1. Spieltag 14.08.2016 Bayern München [A-Junioren] - SC Freiburg [A-Junioren] 2:1
2. Spieltag 17.08.2016 Bayern München [A-Junioren] - Stuttgarter Kickers [A-Junioren] 2:0 Tor
3. Spieltag 21.08.2016 Bayern München [A-Junioren] - TSV 1860 München [A-Junioren] 2:1 Tor
4. Spieltag 27.08.2016 1899 Hoffenheim [A-Junioren] - Bayern München [A-Junioren] 2:5 Tor
5. Spieltag 10.09.2016 Bayern München [A-Junioren] - 1. FSV Mainz 05 [A-Junioren] 1:4
6. Spieltag 18.09.2016 1. FC Kaiserslautern [A-Junioren] - Bayern München [A-Junioren] 2:1
7. Spieltag 24.09.2016 Karlsruher SC [A-Junioren] - Bayern München [A-Junioren] 2:0
8. Spieltag 15.10.2016 Bayern München [A-Junioren] - 1. FC Nürnberg [A-Junioren] 2:2
9. Spieltag 23.10.2016 FC Augsburg [A-Junioren] - Bayern München [A-Junioren] 0:0
10. Spieltag 28.10.2016 Bayern München [A-Junioren] - FC Ingolstadt 04 [A-Junioren] 3:1
13. Spieltag 27.11.2016 Bayern München [A-Junioren] - Eintracht Frankfurt [A-Junioren] 3:0
14. Spieltag 03.12.2016 SC Freiburg [A-Junioren] - Bayern München [A-Junioren] 2:2 Tor
15. Spieltag 10.12.2016 Stuttgarter Kickers [A-Junioren] - Bayern München [A-Junioren] 0:2
16. Spieltag 04.02.2017 TSV 1860 München [A-Junioren] - Bayern München [A-Junioren] 0:3 Tor
17. Spieltag 12.02.2017 Bayern München [A-Junioren] - 1899 Hoffenheim [A-Junioren] 1:2
18. Spieltag 19.02.2017 1. FSV Mainz 05 [A-Junioren] - Bayern München [A-Junioren] 0:1
19. Spieltag 25.02.2017 Bayern München [A-Junioren] - 1. FC Kaiserslautern [A-Junioren] 3:0 Tor
20. Spieltag 05.03.2017 Bayern München [A-Junioren] - Karlsruher SC [A-Junioren] 3:0 TorTorTor
21. Spieltag 12.03.2017 1. FC Nürnberg [A-Junioren] - Bayern München [A-Junioren] 2:1
22. Spieltag 02.04.2017 Bayern München [A-Junioren] - FC Augsburg [A-Junioren] 4:2 gelbe Karte
23. Spieltag 07.04.2017 FC Ingolstadt 04 [A-Junioren] - Bayern München [A-Junioren] 0:0
24. Spieltag 22.04.2017 Bayern München [A-Junioren] - VfB Stuttgart [A-Junioren] 3:1
25. Spieltag 29.04.2017 SpVgg Greuther Fürth [A-Junioren] - Bayern München [A-Junioren] 0:5