1. Spieltag 10.09.2016 Atalanta [A-Junioren] - Frosinone Calcio [A-Junioren] 3:2 Tor
2. Spieltag 17.09.2016 FC Crotone [A-Junioren] - Atalanta [A-Junioren] 2:3 Tor
3. Spieltag 23.09.2016 US Palermo [A-Junioren] - Atalanta [A-Junioren] 1:1
4. Spieltag 01.10.2016 Atalanta [A-Junioren] - Novara Calcio [A-Junioren] 3:0 TorTor
5. Spieltag 15.10.2016 Genoa CFC [A-Junioren] - Atalanta [A-Junioren] 2:4 Tor
6. Spieltag 22.10.2016 Atalanta [A-Junioren] - Bologna FC [A-Junioren] 4:2
8. Spieltag 19.11.2016 Atalanta [A-Junioren] - Ternana Calcio [A-Junioren] 5:0 TorTorTor
10. Spieltag 03.12.2016 Atalanta [A-Junioren] - Inter [A-Junioren] 1:2 Tor
11. Spieltag 10.12.2016 AC Pisa [A-Junioren] - Atalanta [A-Junioren] 1:1
12. Spieltag 17.12.2016 Atalanta [A-Junioren] - AS Roma [A-Junioren] 1:0 Tor
13. Spieltag 14.01.2017 US Salernitana 1919 [A-Junioren] - Atalanta [A-Junioren] 0:1
14. Spieltag 21.01.2017 Frosinone Calcio [A-Junioren] - Atalanta [A-Junioren] 2:1
15. Spieltag 28.01.2017 Atalanta [A-Junioren] - FC Crotone [A-Junioren] 3:0
16. Spieltag 04.02.2017 Atalanta [A-Junioren] - US Palermo [A-Junioren] 1:0
17. Spieltag 11.02.2017 Novara Calcio [A-Junioren] - Atalanta [A-Junioren] 0:3
18. Spieltag 18.02.2017 Atalanta [A-Junioren] - Genoa CFC [A-Junioren] 5:1 TorTor
19. Spieltag 25.02.2017 Bologna FC [A-Junioren] - Atalanta [A-Junioren] 1:2
20. Spieltag 04.03.2017 Atalanta [A-Junioren] - Cagliari Calcio [A-Junioren] 3:0
21. Spieltag 11.03.2017 Ternana Calcio [A-Junioren] - Atalanta [A-Junioren] 0:1
22. Spieltag 01.04.2017 Atalanta [A-Junioren] - Virtus Entella [A-Junioren] 2:2
23. Spieltag 08.04.2017 Inter [A-Junioren] - Atalanta [A-Junioren] 1:3 TorTorTor
25. Spieltag 29.04.2017 AS Roma [A-Junioren] - Atalanta [A-Junioren] 0:3