1. Spieltag 30.07.2016 1. FC Köln II - Borussia Dortmund II 1:4 TorTor
2. Spieltag 06.08.2016 Borussia Dortmund II - Sportfreunde Siegen 2:0 Tor
3. Spieltag 09.08.2016 SG Wattenscheid 09 - Borussia Dortmund II 1:1 Tor
4. Spieltag 12.08.2016 Borussia Dortmund II - Rot-Weiß Oberhausen 1:0 Tor
5. Spieltag 20.08.2016 TSG Sprockhövel - Borussia Dortmund II 0:4 TorTor
6. Spieltag 26.08.2016 Borussia Dortmund II - SC Wiedenbrück 2:0 Tor
8. Spieltag 10.09.2016 Borussia Dortmund II - Wuppertaler SV 0:0
9. Spieltag 17.09.2016 Viktoria Köln - Borussia Dortmund II 1:1
7. Spieltag 20.09.2016 Bonner SC - Borussia Dortmund II 2:2 Tor
10. Spieltag 24.09.2016 Borussia Dortmund II - Fortuna Düsseldorf II 2:2 Tor
11. Spieltag 01.10.2016 Rot-Weiss Essen - Borussia Dortmund II 1:1
13. Spieltag 14.10.2016 Rot Weiss Ahlen - Borussia Dortmund II 1:4 Tor gelbe Karte
14. Spieltag 22.10.2016 Borussia Dortmund II - SC Verl 2:0
15. Spieltag 29.10.2016 Alemannia Aachen - Borussia Dortmund II 0:1
16. Spieltag 04.11.2016 Bor. Mönchengladbach II - Borussia Dortmund II 2:2
12. Spieltag 23.11.2016 Borussia Dortmund II - SV Rödinghausen 1:0
18. Spieltag 26.11.2016 Borussia Dortmund II - 1. FC Köln II 2:1 Tor
20. Spieltag 10.12.2016 Borussia Dortmund II - SG Wattenscheid 09 1:0 gelbe Karte
17. Spieltag 17.12.2016 Borussia Dortmund II - FC Schalke 04 II 0:0
22. Spieltag 25.02.2017 Borussia Dortmund II - TSG Sprockhövel 4:1 TorTor
23. Spieltag 04.03.2017 SC Wiedenbrück - Borussia Dortmund II 1:1 gelbe Karte
24. Spieltag 11.03.2017 Borussia Dortmund II - Bonner SC 2:0 Tor
25. Spieltag 17.03.2017 Wuppertaler SV - Borussia Dortmund II 1:0
26. Spieltag 25.03.2017 Borussia Dortmund II - Viktoria Köln 2:3 Tor
27. Spieltag 01.04.2017 Fortuna Düsseldorf II - Borussia Dortmund II 3:2
19. Spieltag 04.04.2017 Sportfreunde Siegen - Borussia Dortmund II 0:4
28. Spieltag 08.04.2017 Borussia Dortmund II - Rot-Weiss Essen 1:1
29. Spieltag 13.04.2017 SV Rödinghausen - Borussia Dortmund II 1:1
30. Spieltag 22.04.2017 Borussia Dortmund II - Rot Weiss Ahlen 1:1 Tor
31. Spieltag 29.04.2017 SC Verl - Borussia Dortmund II 0:0
32. Spieltag 07.05.2017 Borussia Dortmund II - Alemannia Aachen 0:0
33. Spieltag 13.05.2017 Borussia Dortmund II - Bor. Mönchengladbach II 2:1 TorTor
34. Spieltag 20.05.2017 FC Schalke 04 II - Borussia Dortmund II 0:1