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| 24.08.2012 | 18:00 | Hertha BSC | - | Jahn Regensburg | 2:1 (2:0) | |
| 18:00 | Eintracht Braunschweig | - | SC Paderborn 07 | 2:1 (0:1) | ||
| 18:00 | SV Sandhausen | - | 1. FC Union Berlin | 2:0 (1:0) | ||
| 25.08.2012 | 13:00 | MSV Duisburg | - | Dynamo Dresden | 1:3 (0:2) | |
| 13:00 | Energie Cottbus | - | FC St. Pauli | 2:0 (1:0) | ||
| 26.08.2012 | 13:30 | 1. FC Kaiserslautern | - | TSV 1860 München | 0:0 (0:0) | |
| 13:30 | VfL Bochum | - | VfR Aalen | 0:1 (0:0) | ||
| 13:30 | FC Ingolstadt 04 | - | FSV Frankfurt | 0:2 (0:1) | ||
| 27.08.2012 | 20:15 | Erzgebirge Aue | - | 1. FC Köln | 2:0 (1:0) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
Eintracht Braunschweig | 3 | 3 | 0 | 0 | 4:1 | 3 | 9 |
| 2 |
|
Energie Cottbus | 3 | 2 | 1 | 0 | 7:2 | 5 | 7 |
| 3 |
|
FSV Frankfurt | 3 | 2 | 1 | 0 | 6:2 | 4 | 7 |
| 4 |
|
VfR Aalen | 3 | 2 | 0 | 1 | 6:3 | 3 | 6 |
| 5 |
|
SV Sandhausen | 3 | 1 | 2 | 0 | 4:2 | 2 | 5 |
| 6 |
|
1. FC Kaiserslautern | 3 | 1 | 2 | 0 | 5:4 | 1 | 5 |
| 7 |
|
TSV 1860 München | 3 | 1 | 2 | 0 | 3:2 | 1 | 5 |
| 8 |
|
SC Paderborn 07 | 3 | 1 | 1 | 1 | 7:4 | 3 | 4 |
| 9 |
|
Dynamo Dresden | 3 | 1 | 1 | 1 | 6:5 | 1 | 4 |
| 10 |
|
Hertha BSC | 3 | 1 | 1 | 1 | 5:6 | -1 | 4 |
| 11 |
|
Erzgebirge Aue | 3 | 1 | 1 | 1 | 2:3 | -1 | 4 |
| 12 |
|
Jahn Regensburg | 3 | 1 | 0 | 2 | 3:3 | 0 | 3 |
| 13 |
|
VfL Bochum | 3 | 1 | 0 | 2 | 2:6 | -4 | 3 |
| 14 |
|
FC Ingolstadt 04 | 3 | 0 | 2 | 1 | 3:5 | -2 | 2 |
| 15 |
|
FC St. Pauli | 3 | 0 | 2 | 1 | 1:3 | -2 | 2 |
| 16 |
|
1. FC Union Berlin | 3 | 0 | 1 | 2 | 3:6 | -3 | 1 |
| 17 |
|
1. FC Köln | 3 | 0 | 1 | 2 | 1:4 | -3 | 1 |
| 18 |
|
MSV Duisburg | 3 | 0 | 0 | 3 | 2:9 | -7 | 0 |
| Aufstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Am 19.6. wurde endgültig entschieden, dass der MSV Duisburg keine Lizenz für die Zweitligasaison 2013/2014 erhält. Der sportlich abgestiegene SV Sandhausen bleibt damit eine weitere Saison in der 2. Bundesliga. |
