# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SpVgg Unterhaching, Deutschland SpVgg Unterhaching 20 10 5 5 21:17 4 35
2 SV Wehen Wiesbaden, Deutschland SV Wehen Wiesbaden 20 9 6 5 21:12 9 33
3 SC Paderborn 07, Deutschland SC Paderborn 07 20 9 6 5 23:15 8 33
4 SG Sonnenhof Großaspach, Deutschland SG Sonnenhof Großaspach 20 9 6 5 18:11 7 33
5 Hansa Rostock, Deutschland Hansa Rostock 20 9 6 5 17:10 7 33
6 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 20 10 3 7 16:12 4 33
7 Würzburger Kickers, Deutschland Würzburger Kickers 20 9 5 6 21:21 0 32
8 Fortuna Köln, Deutschland Fortuna Köln 20 9 4 7 19:13 6 31
9 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 20 8 6 6 11:8 3 30
  Karlsruher SC, Deutschland Karlsruher SC 20 8 6 6 11:8 3 30
11 Sportfreunde Lotte, Deutschland Sportfreunde Lotte 20 6 7 7 12:12 0 25
12 FSV Zwickau, Deutschland FSV Zwickau 20 6 6 8 10:16 -6 24
13 Preußen Münster, Deutschland Preußen Münster 20 6 5 9 14:14 0 23
14 SV Meppen, Deutschland SV Meppen 20 6 5 9 14:18 -4 23
15 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 20 5 8 7 14:21 -7 23
16 VfR Aalen, Deutschland VfR Aalen 20 5 7 8 15:17 -2 22
17 FC Carl Zeiss Jena, Deutschland FC Carl Zeiss Jena 20 5 7 8 12:19 -7 22
18 VfL Osnabrück, Deutschland VfL Osnabrück 20 4 9 7 10:15 -5 21
19 Werder Bremen II, Deutschland Werder Bremen II 20 3 10 7 10:17 -7 19
20 Rot-Weiß Erfurt, Deutschland Rot-Weiß Erfurt 20 1 9 10 5:18 -13 12
  Aufstieg
  Relegation
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen.

# Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt.