# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SC Paderborn 07, Deutschland SC Paderborn 07 26 16 5 5 55:26 29 53
2 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 26 17 2 7 41:25 16 53
3 SV Wehen Wiesbaden, Deutschland SV Wehen Wiesbaden 26 14 5 7 52:23 29 47
4 Hansa Rostock, Deutschland Hansa Rostock 26 14 5 7 36:23 13 47
5 Karlsruher SC, Deutschland Karlsruher SC 26 13 8 5 29:19 10 47
6 Fortuna Köln, Deutschland Fortuna Köln 26 12 8 6 39:29 10 44
7 SpVgg Unterhaching, Deutschland SpVgg Unterhaching 26 12 3 11 39:38 1 39
8 VfR Aalen, Deutschland VfR Aalen 26 10 8 8 37:33 4 38
9 SV Meppen, Deutschland SV Meppen 26 9 10 7 29:30 -1 37
10 Würzburger Kickers, Deutschland Würzburger Kickers 26 10 6 10 33:36 -3 36
11 SG Sonnenhof Großaspach, Deutschland SG Sonnenhof Großaspach 26 9 7 10 32:37 -5 34
12 FC Carl Zeiss Jena, Deutschland FC Carl Zeiss Jena 26 8 8 10 28:33 -5 32
13 VfL Osnabrück, Deutschland VfL Osnabrück 26 8 8 10 35:41 -6 32
14 FSV Zwickau, Deutschland FSV Zwickau 26 8 7 11 27:35 -8 31
15 Preußen Münster, Deutschland Preußen Münster 26 8 6 12 31:36 -5 30
16 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 26 7 8 11 34:38 -4 29
17 Sportfreunde Lotte, Deutschland Sportfreunde Lotte 26 8 5 13 31:40 -9 29
18 Werder Bremen II, Deutschland Werder Bremen II 26 3 9 14 24:45 -21 18
19 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 26 6 4 16 32:51 -19 13
20 Rot-Weiß Erfurt, Deutschland Rot-Weiß Erfurt 26 4 6 16 15:41 -26 8
  Aufstieg
  Relegation
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen.

# Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt.