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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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SC Paderborn 07 | 27 | 15 | 8 | 4 | 28:10 | 18 | 53 |
| 2 |
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SV Wehen Wiesbaden | 27 | 11 | 11 | 5 | 25:10 | 15 | 44 |
| 3 |
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Hansa Rostock | 27 | 11 | 10 | 6 | 16:10 | 6 | 43 |
| 4 |
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1. FC Magdeburg | 27 | 10 | 11 | 6 | 28:15 | 13 | 41 |
| 5 |
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Karlsruher SC | 27 | 9 | 13 | 5 | 13:10 | 3 | 40 |
| 6 |
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VfR Aalen | 27 | 9 | 12 | 6 | 18:13 | 5 | 39 |
| 7 |
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Fortuna Köln | 27 | 8 | 14 | 5 | 19:15 | 4 | 38 |
| 8 |
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SV Meppen | 27 | 9 | 11 | 7 | 15:12 | 3 | 38 |
| 9 |
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FC Carl Zeiss Jena | 27 | 6 | 17 | 4 | 14:12 | 2 | 35 |
| 10 |
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FSV Zwickau | 27 | 9 | 8 | 10 | 17:18 | -1 | 35 |
| 11 |
|
VfL Osnabrück | 27 | 9 | 8 | 10 | 19:23 | -4 | 35 |
| 12 |
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Chemnitzer FC | 27 | 7 | 12 | 8 | 15:20 | -5 | 33 |
| 13 |
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SpVgg Unterhaching | 27 | 7 | 9 | 11 | 17:18 | -1 | 30 |
| 14 |
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Preußen Münster | 27 | 7 | 9 | 11 | 13:20 | -7 | 30 |
| 15 |
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Würzburger Kickers | 27 | 7 | 9 | 11 | 9:16 | -7 | 30 |
| 16 |
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Hallescher FC | 27 | 6 | 11 | 10 | 15:19 | -4 | 29 |
| 17 |
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Werder Bremen II | 27 | 5 | 14 | 8 | 12:20 | -8 | 29 |
| 18 |
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Sportfreunde Lotte | 27 | 5 | 13 | 9 | 16:22 | -6 | 28 |
| 19 |
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SG Sonnenhof Großaspach | 27 | 6 | 10 | 11 | 12:24 | -12 | 28 |
| 20 |
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Rot-Weiß Erfurt | 27 | 2 | 14 | 11 | 7:21 | -14 | 20 |
| Aufstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen. # Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. |
