# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SC Paderborn 07, Deutschland SC Paderborn 07 29 17 7 5 60:30 30 58
2 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 29 18 4 7 50:29 21 58
3 SV Wehen Wiesbaden, Deutschland SV Wehen Wiesbaden 29 17 5 7 62:26 36 56
4 Karlsruher SC, Deutschland Karlsruher SC 29 15 9 5 36:22 14 54
5 Fortuna Köln, Deutschland Fortuna Köln 29 15 8 6 47:29 18 53
6 Hansa Rostock, Deutschland Hansa Rostock 29 14 6 9 39:28 11 48
7 SpVgg Unterhaching, Deutschland SpVgg Unterhaching 29 13 5 11 43:41 2 44
8 Würzburger Kickers, Deutschland Würzburger Kickers 29 12 7 10 38:39 -1 43
9 SV Meppen, Deutschland SV Meppen 29 10 12 7 34:34 0 42
10 VfR Aalen, Deutschland VfR Aalen 29 10 10 9 40:41 -1 40
11 FSV Zwickau, Deutschland FSV Zwickau 29 9 9 11 30:37 -7 36
12 VfL Osnabrück, Deutschland VfL Osnabrück 29 8 10 11 41:48 -7 34
13 SG Sonnenhof Großaspach, Deutschland SG Sonnenhof Großaspach 29 9 7 13 35:45 -10 34
14 Preußen Münster, Deutschland Preußen Münster 29 8 9 12 34:39 -5 33
15 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 29 8 9 12 36:42 -6 33
16 FC Carl Zeiss Jena, Deutschland FC Carl Zeiss Jena 29 8 9 12 32:39 -7 33
17 Sportfreunde Lotte, Deutschland Sportfreunde Lotte 29 8 6 15 33:46 -13 30
18 Werder Bremen II, Deutschland Werder Bremen II 29 3 11 15 25:47 -22 20
19 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 29 6 5 18 34:59 -25 14
20 Rot-Weiß Erfurt, Deutschland Rot-Weiß Erfurt 29 4 8 17 21:49 -28 10
  Aufstieg
  Relegation
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen.

# Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt.