# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SC Paderborn 07, Deutschland SC Paderborn 07 31 19 7 5 64:30 34 64
2 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 31 20 4 7 57:30 27 64
3 SV Wehen Wiesbaden, Deutschland SV Wehen Wiesbaden 31 19 5 7 69:29 40 62
4 Karlsruher SC, Deutschland Karlsruher SC 31 16 10 5 38:22 16 58
5 Fortuna Köln, Deutschland Fortuna Köln 31 15 8 8 49:34 15 53
6 Hansa Rostock, Deutschland Hansa Rostock 31 14 7 10 39:29 10 49
7 SpVgg Unterhaching, Deutschland SpVgg Unterhaching 31 14 5 12 46:45 1 47
8 VfR Aalen, Deutschland VfR Aalen 31 11 11 9 43:43 0 44
9 Würzburger Kickers, Deutschland Würzburger Kickers 31 12 8 11 40:42 -2 44
10 SV Meppen, Deutschland SV Meppen 31 10 12 9 35:39 -4 42
11 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 31 10 9 12 40:42 -2 39
12 Preußen Münster, Deutschland Preußen Münster 31 10 9 12 37:39 -2 39
13 FSV Zwickau, Deutschland FSV Zwickau 31 9 10 12 32:41 -9 37
14 SG Sonnenhof Großaspach, Deutschland SG Sonnenhof Großaspach 31 10 7 14 38:49 -11 37
15 VfL Osnabrück, Deutschland VfL Osnabrück 31 8 10 13 41:51 -10 34
16 FC Carl Zeiss Jena, Deutschland FC Carl Zeiss Jena 31 8 10 13 33:44 -11 34
17 Sportfreunde Lotte, Deutschland Sportfreunde Lotte 31 9 6 16 36:48 -12 33
18 Werder Bremen II, Deutschland Werder Bremen II 31 3 11 17 26:51 -25 20
19 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 31 7 5 19 37:63 -26 17
20 Rot-Weiß Erfurt, Deutschland Rot-Weiß Erfurt 31 5 8 18 25:54 -29 13
  Aufstieg
  Relegation
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen.

# Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt.