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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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SC Paderborn 07 | 31 | 15 | 11 | 5 | 28:12 | 16 | 56 |
| 2 |
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SV Wehen Wiesbaden | 31 | 14 | 12 | 5 | 31:12 | 19 | 54 |
| 3 |
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1. FC Magdeburg | 31 | 12 | 13 | 6 | 34:16 | 18 | 49 |
| 4 |
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Hansa Rostock | 31 | 12 | 13 | 6 | 18:10 | 8 | 49 |
| 5 |
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Karlsruher SC | 31 | 11 | 15 | 5 | 16:11 | 5 | 48 |
| 6 |
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Fortuna Köln | 31 | 10 | 15 | 6 | 24:17 | 7 | 45 |
| 7 |
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VfR Aalen | 31 | 10 | 14 | 7 | 21:16 | 5 | 44 |
| 8 |
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SV Meppen | 31 | 10 | 11 | 10 | 16:15 | 1 | 41 |
| 9 |
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FC Carl Zeiss Jena | 31 | 7 | 18 | 6 | 16:18 | -2 | 39 |
| 10 |
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FSV Zwickau | 31 | 9 | 11 | 11 | 17:20 | -3 | 38 |
| 11 |
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SpVgg Unterhaching | 31 | 9 | 10 | 12 | 20:19 | 1 | 37 |
| 12 |
|
Hallescher FC | 31 | 8 | 13 | 10 | 17:19 | -2 | 37 |
| 13 |
|
Preußen Münster | 31 | 9 | 10 | 12 | 16:22 | -6 | 37 |
| 14 |
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Würzburger Kickers | 31 | 9 | 10 | 12 | 12:18 | -6 | 37 |
| 15 |
|
Chemnitzer FC | 31 | 8 | 13 | 10 | 17:25 | -8 | 37 |
| 16 |
|
VfL Osnabrück | 31 | 9 | 9 | 13 | 19:26 | -7 | 36 |
| 17 |
|
SG Sonnenhof Großaspach | 31 | 7 | 12 | 12 | 15:27 | -12 | 33 |
| 18 |
|
Werder Bremen II | 31 | 5 | 17 | 9 | 12:22 | -10 | 32 |
| 19 |
|
Sportfreunde Lotte | 31 | 6 | 13 | 12 | 18:25 | -7 | 31 |
| 20 |
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Rot-Weiß Erfurt | 31 | 2 | 16 | 13 | 9:26 | -17 | 22 |
| Aufstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen. # Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. |
