# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SC Paderborn 07, Deutschland SC Paderborn 07 32 20 7 5 69:30 39 67
2 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 32 21 4 7 58:30 28 67
3 SV Wehen Wiesbaden, Deutschland SV Wehen Wiesbaden 32 19 5 8 69:31 38 62
4 Karlsruher SC, Deutschland Karlsruher SC 32 17 10 5 41:22 19 61
5 Fortuna Köln, Deutschland Fortuna Köln 32 15 8 9 49:36 13 53
6 Hansa Rostock, Deutschland Hansa Rostock 32 14 8 10 40:30 10 50
7 SpVgg Unterhaching, Deutschland SpVgg Unterhaching 32 14 5 13 46:46 0 47
8 Würzburger Kickers, Deutschland Würzburger Kickers 32 13 8 11 42:42 0 47
9 SV Meppen, Deutschland SV Meppen 32 11 12 9 37:39 -2 45
10 VfR Aalen, Deutschland VfR Aalen 32 11 11 10 43:48 -5 44
11 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 32 11 9 12 43:42 1 42
12 SG Sonnenhof Großaspach, Deutschland SG Sonnenhof Großaspach 32 11 7 14 41:51 -10 40
13 Preußen Münster, Deutschland Preußen Münster 32 10 9 13 37:42 -5 39
14 FC Carl Zeiss Jena, Deutschland FC Carl Zeiss Jena 32 9 10 13 35:45 -10 37
15 FSV Zwickau, Deutschland FSV Zwickau 32 9 10 13 33:43 -10 37
16 Sportfreunde Lotte, Deutschland Sportfreunde Lotte 32 10 6 16 39:50 -11 36
17 VfL Osnabrück, Deutschland VfL Osnabrück 32 8 11 13 42:52 -10 35
18 Werder Bremen II, Deutschland Werder Bremen II 32 3 11 18 28:54 -26 20
19 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 32 7 5 20 39:66 -27 17
20 Rot-Weiß Erfurt, Deutschland Rot-Weiß Erfurt 32 5 8 19 25:57 -32 13
  Aufstieg
  Relegation
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen.

# Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt.