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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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SC Paderborn 07 | 35 | 18 | 10 | 7 | 46:18 | 28 | 64 |
| 2 |
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SV Wehen Wiesbaden | 35 | 17 | 9 | 9 | 39:21 | 18 | 60 |
| 3 |
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Würzburger Kickers | 35 | 16 | 12 | 7 | 32:25 | 7 | 60 |
| 4 |
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1. FC Magdeburg | 35 | 15 | 13 | 7 | 28:15 | 13 | 58 |
| 5 |
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Karlsruher SC | 35 | 15 | 12 | 8 | 26:15 | 11 | 57 |
| 6 |
|
SG Sonnenhof Großaspach | 35 | 15 | 9 | 11 | 29:25 | 4 | 54 |
| 7 |
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Hallescher FC | 35 | 15 | 6 | 14 | 27:26 | 1 | 51 |
| 8 |
|
Hansa Rostock | 35 | 13 | 11 | 11 | 23:20 | 3 | 50 |
| 9 |
|
Fortuna Köln | 35 | 13 | 10 | 12 | 27:21 | 6 | 49 |
| 10 |
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SpVgg Unterhaching | 35 | 13 | 9 | 13 | 27:28 | -1 | 48 |
| 11 |
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Sportfreunde Lotte | 35 | 11 | 13 | 11 | 23:25 | -2 | 46 |
| 12 |
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Preußen Münster | 35 | 10 | 12 | 13 | 23:22 | 1 | 42 |
| 13 |
|
VfR Aalen | 35 | 10 | 12 | 13 | 26:33 | -7 | 42 |
| 14 |
|
SV Meppen | 35 | 10 | 11 | 14 | 23:28 | -5 | 41 |
| 15 |
|
FSV Zwickau | 35 | 9 | 14 | 12 | 18:25 | -7 | 41 |
| 16 |
|
VfL Osnabrück | 35 | 9 | 13 | 13 | 24:31 | -7 | 40 |
| 17 |
|
FC Carl Zeiss Jena | 35 | 9 | 12 | 14 | 24:32 | -8 | 39 |
| 18 |
|
Chemnitzer FC | 35 | 8 | 13 | 14 | 24:41 | -17 | 37 |
| 19 |
|
Werder Bremen II | 35 | 5 | 14 | 16 | 16:37 | -21 | 29 |
| 20 |
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Rot-Weiß Erfurt | 35 | 5 | 13 | 17 | 16:33 | -17 | 28 |
| Aufstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen. # Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. |
