# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 36 25 4 7 66:31 35 79
2 SC Paderborn 07, Deutschland SC Paderborn 07 36 23 8 5 83:30 53 77
3 Karlsruher SC, Deutschland Karlsruher SC 36 18 12 6 45:26 19 66
4 SV Wehen Wiesbaden, Deutschland SV Wehen Wiesbaden 36 20 5 11 73:36 37 65
5 Würzburger Kickers, Deutschland Würzburger Kickers 36 16 9 11 49:44 5 57
6 Hansa Rostock, Deutschland Hansa Rostock 36 15 11 10 43:31 12 56
7 SV Meppen, Deutschland SV Meppen 36 14 13 9 46:45 1 55
8 Fortuna Köln, Deutschland Fortuna Köln 36 15 9 12 51:43 8 54
9 SpVgg Unterhaching, Deutschland SpVgg Unterhaching 36 15 6 15 49:52 -3 51
10 VfR Aalen, Deutschland VfR Aalen 36 13 11 12 48:53 -5 50
11 Preußen Münster, Deutschland Preußen Münster 36 13 9 14 45:47 -2 48
12 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 36 12 10 14 48:50 -2 46
13 FC Carl Zeiss Jena, Deutschland FC Carl Zeiss Jena 36 12 10 14 44:56 -12 46
14 SG Sonnenhof Großaspach, Deutschland SG Sonnenhof Großaspach 36 12 9 15 52:57 -5 45
15 Sportfreunde Lotte, Deutschland Sportfreunde Lotte 36 11 7 18 43:56 -13 40
16 FSV Zwickau, Deutschland FSV Zwickau 36 9 11 16 37:53 -16 38
17 VfL Osnabrück, Deutschland VfL Osnabrück 36 8 12 16 45:62 -17 36
18 Werder Bremen II, Deutschland Werder Bremen II 36 5 12 19 36:60 -24 27
19 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 36 8 6 22 46:70 -24 21
20 Rot-Weiß Erfurt, Deutschland Rot-Weiß Erfurt 36 5 8 23 25:72 -47 13
  Aufstieg
  Relegation
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen.

# Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt.