# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 37 26 4 7 69:32 37 82
2 SC Paderborn 07, Deutschland SC Paderborn 07 37 24 8 5 86:31 55 80
3 Karlsruher SC, Deutschland Karlsruher SC 37 19 12 6 47:26 21 69
4 SV Wehen Wiesbaden, Deutschland SV Wehen Wiesbaden 37 20 5 12 74:39 35 65
5 Hansa Rostock, Deutschland Hansa Rostock 37 16 11 10 47:33 14 59
6 Würzburger Kickers, Deutschland Würzburger Kickers 37 16 10 11 50:45 5 58
7 SV Meppen, Deutschland SV Meppen 37 15 13 9 49:45 4 58
8 Fortuna Köln, Deutschland Fortuna Köln 37 15 9 13 51:44 7 54
9 Preußen Münster, Deutschland Preußen Münster 37 14 9 14 48:47 1 51
10 SpVgg Unterhaching, Deutschland SpVgg Unterhaching 37 15 6 16 50:54 -4 51
11 VfR Aalen, Deutschland VfR Aalen 37 13 11 13 48:55 -7 50
12 FC Carl Zeiss Jena, Deutschland FC Carl Zeiss Jena 37 13 10 14 46:57 -11 49
13 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 37 12 10 15 50:54 -4 46
14 SG Sonnenhof Großaspach, Deutschland SG Sonnenhof Großaspach 37 12 10 15 53:58 -5 46
15 FSV Zwickau, Deutschland FSV Zwickau 37 10 11 16 38:53 -15 41
16 Sportfreunde Lotte, Deutschland Sportfreunde Lotte 37 11 7 19 43:59 -16 40
17 VfL Osnabrück, Deutschland VfL Osnabrück 37 8 13 16 46:63 -17 37
18 Werder Bremen II, Deutschland Werder Bremen II 37 5 13 19 37:61 -24 28
19 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 37 8 6 23 47:73 -26 21
20 Rot-Weiß Erfurt, Deutschland Rot-Weiß Erfurt 37 5 8 24 25:75 -50 13
  Aufstieg
  Relegation
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen.

# Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt.