# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 38 27 4 7 70:32 38 85
2 SC Paderborn 07, Deutschland SC Paderborn 07 38 25 8 5 90:33 57 83
3 Karlsruher SC, Deutschland Karlsruher SC 38 19 12 7 49:29 20 69
4 SV Wehen Wiesbaden, Deutschland SV Wehen Wiesbaden 38 21 5 12 76:39 37 68
5 Würzburger Kickers, Deutschland Würzburger Kickers 38 17 10 11 53:46 7 61
6 Hansa Rostock, Deutschland Hansa Rostock 38 16 12 10 48:34 14 60
7 SV Meppen, Deutschland SV Meppen 38 15 13 10 50:47 3 58
8 Fortuna Köln, Deutschland Fortuna Köln 38 15 9 14 53:48 5 54
9 SpVgg Unterhaching, Deutschland SpVgg Unterhaching 38 16 6 16 54:55 -1 54
10 Preußen Münster, Deutschland Preußen Münster 38 14 10 14 50:49 1 52
11 FC Carl Zeiss Jena, Deutschland FC Carl Zeiss Jena 38 14 10 14 49:59 -10 52
12 VfR Aalen, Deutschland VfR Aalen 38 13 11 14 48:57 -9 50
13 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 38 13 10 15 52:54 -2 49
14 SG Sonnenhof Großaspach, Deutschland SG Sonnenhof Großaspach 38 12 11 15 55:60 -5 47
15 FSV Zwickau, Deutschland FSV Zwickau 38 10 11 17 38:55 -17 41
16 Sportfreunde Lotte, Deutschland Sportfreunde Lotte 38 11 7 20 43:60 -17 40
17 VfL Osnabrück, Deutschland VfL Osnabrück 38 8 13 17 47:67 -20 37
18 Werder Bremen II, Deutschland Werder Bremen II 38 6 13 19 39:62 -23 31
19 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 38 8 7 23 48:74 -26 22
20 Rot-Weiß Erfurt, Deutschland Rot-Weiß Erfurt 38 5 8 25 26:78 -52 13
  Aufstieg
  Relegation
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen.

# Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt.