H Al Ittihad Tripolis - Mogas 90 FC 3:0
R Mogas 90 FC - Al Ittihad Tripolis 0:1
H: 26.01.2007 R: 11.02.2007 Sieger: Al Ittihad Tripolis
H Espérance de Tunis - Renaissance FC 4:0
R Renaissance FC - Espérance de Tunis 1:2
H: 26.01.2007 R: 10.02.2007 Sieger: Espérance de Tunis
H JS Kabylie - CF Os Balantas Mansoa 3:1
R CF Os Balantas Mansoa - JS Kabylie 1:2
H: 26.01.2007 R: 10.02.2007 Sieger: JS Kabylie
H Highlanders FC - Pamplemousses SC 1:0
R Pamplemousses SC - Highlanders FC 8:9 i.E.
H: 27.01.2007 R: 11.02.2007 Sieger: Highlanders FC
H Mamelodi Sundowns - Royal Leopards 4:2
R Royal Leopards - Mamelodi Sundowns 0:2
H: 27.01.2007 R: 11.02.2007 Sieger: Mamelodi Sundowns
H ASFA Yennenga - Nasarawa United 1:1
R Nasarawa United - ASFA Yennenga 2:0
H: 27.01.2007 R: 11.02.2007 Sieger: Nasarawa United
H ASC Diaraf - Maranatha FC 1:0
R Maranatha FC - ASC Diaraf 2:0
H: 27.01.2007 R: 11.02.2007 Sieger: Maranatha FC
H FC St. Eloi Lupopo - APR FC 1:2
R APR FC - FC St. Eloi Lupopo 2:0
H: 27.01.2007 R: 10.02.2007 Sieger: APR FC
H USM Alger - AS FNIS 3:1
R AS FNIS - USM Alger 2:0
H: 27.01.2007 R: 11.02.2007 Sieger: AS FNIS
H Petro Atlético - Civics FC 1:0
R Civics FC - Petro Atlético 1:1
H: 27.01.2007 R: 10.02.2007 Sieger: Petro Atlético
H Young Africans - AJSM 5:1
R AJSM - Young Africans n.gesp.
H: 27.01.2007 R: 09.02.2007 Sieger: Young Africans
H Zamalek - Vital'O 4:1
R Vital'O - Zamalek 0:1
H: 28.01.2007 R: 10.02.2007 Sieger: Zamalek
H Al Hilal Omdurman - AS Polisi 4:0
R AS Polisi - Al Hilal Omdurman 0:2
H: 28.01.2007 R: 10.02.2007 Sieger: Al Hilal Omdurman
H Fello Star - Sporting Praia 0:0
R Sporting Praia - Fello Star n.gesp.
H: 28.01.2007 R: 09.02.2007
H Canon Yaoundé - AS Etoile du Congo 1:0
R AS Etoile du Congo - Canon Yaoundé 2:0
H: 28.01.2007 R: 11.02.2007 Sieger: AS Etoile du Congo
H Wydad AC - ASC Mauritel Mobile FC 4:0
R ASC Mauritel Mobile FC - Wydad AC 2:1
H: 28.01.2007 R: 10.02.2007 Sieger: Wydad AC
H Stade Malien - AS Douanes 1:2
R AS Douanes - Stade Malien 2:0
H: 28.01.2007 R: 10.02.2007 Sieger: AS Douanes
H Ocean Boys - Kallon FC 0:0
R Kallon FC - Ocean Boys 1:0
H: 28.01.2007 R: 11.02.2007 Sieger: Kallon FC
H Likhopo - Zanaco FC 0:0
R Zanaco FC - Likhopo 1:0
H: 28.01.2007 R: 10.02.2007 Sieger: Zanaco FC
H Renacimiento FC - Ashanti Gold 0:1
R Ashanti Gold - Renacimiento FC 1:0
H: 28.01.2007 R: 11.02.2007 Sieger: Ashanti Gold
H TP Mazembe - Police XI FC 3:0
R Police XI FC - TP Mazembe 2:4
H: 28.01.2007 R: 11.02.2007 Sieger: TP Mazembe
H AS Adema - Anse Réunion FC 0:0
R Anse Réunion FC - AS Adema 0:3
H: 28.01.2007 R: 11.02.2007 Sieger: AS Adema
H CD 1º de Agosto - Mangasport Moanda 0:1
R Mangasport Moanda - CD 1º de Agosto 1:1
H: 28.01.2007 R: 11.02.2007 Sieger: Mangasport Moanda
H Coton Sport Garoua - URA SC 3:0
R URA SC - Coton Sport Garoua 0:0
H: 28.01.2007 R: 10.02.2007 Sieger: Coton Sport Garoua
H Séwé Sport - Mighty Barolle 3:0
R Mighty Barolle - Séwé Sport 1:0
H: 28.01.2007 R: 11.02.2007 Sieger: Séwé Sport
H Asante Kotoko - Ports Authority FC 1:0
R Ports Authority FC - Asante Kotoko 4:2 i.E.
H: 03.02.2007 R: 11.02.2007 Sieger: Ports Authority FC

# Saint-Pierroise zog seine Mannschaft aus dem Wettbewerb zurück. Dadurch erreicht GD Maputo die 2. Runde kampflos.

# Escom zog seine Mannschaft aus dem Wettbewerb zurück. Dadurch erreicht St. George aus Addis Abeba die 2. Runde kampflos.

# Zwischen Young Africans und AGSM wird nur eine Begegnung ausgetragen. Die Mannschaft von den Komoren hat kein Stadion, das internationalen Ansprüchen genügt.

# Sporting Praia wurde nach dem Hinspiel disqualifiziert. Dadurch kommt Fello Star eine Runde weiter.

# Da AS Douanes einen nicht berechtigten Spieler einsetzte, kommt Stade Malien in die nächste Runde.