# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Flora, Estland FC Flora 16 14 2 0 50:7 43 44
2 FC Levadia, Estland FC Levadia 16 13 3 0 47:8 39 42
3 JK Nõmme Kalju, Estland JK Nõmme Kalju 16 11 3 2 46:14 32 36
4 FC Infonet, Estland FC Infonet 16 7 3 6 42:19 23 24
5 JK Narva Trans, Estland JK Narva Trans 16 7 3 6 25:21 4 24
6 JK Tammeka, Estland JK Tammeka 16 3 6 7 15:27 -12 15
7 Paide Linnameeskond, Estland Paide Linnameeskond 16 4 3 9 19:40 -21 15
8 JK Sillamäe Kalev, Estland JK Sillamäe Kalev 16 3 3 10 17:37 -20 12
9 Tulevik Viljandi, Estland Tulevik Viljandi 16 2 1 13 9:47 -38 7
10 Pärnu JK Vaprus, Estland Pärnu JK Vaprus 16 2 1 13 14:64 -50 7
  Champions League Quali.
  Abstieg

# Pärnu Linnameskond wurde am 11. Januar 2017 aufgelöst. Die Erstligalizenz ging an Pärnu JK Vaprus.

# JK Sillamäe Kalev steht am Ende der Saison 2017 als einziger Absteiger durch Lizenzentzug fest.