# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Flora, Estland FC Flora 27 22 4 1 79:19 60 70
2 FC Levadia, Estland FC Levadia 27 19 6 2 80:16 64 63
3 JK Nõmme Kalju, Estland JK Nõmme Kalju 27 19 3 5 72:23 49 60
4 FC Infonet, Estland FC Infonet 27 17 3 7 83:31 52 54
5 JK Narva Trans, Estland JK Narva Trans 27 9 5 13 34:41 -7 32
6 JK Tammeka, Estland JK Tammeka 27 7 7 13 31:47 -16 28
7 JK Sillamäe Kalev, Estland JK Sillamäe Kalev 27 7 5 15 38:60 -22 26
8 Paide Linnameeskond, Estland Paide Linnameeskond 27 6 6 15 31:68 -37 24
9 Tulevik Viljandi, Estland Tulevik Viljandi 27 6 1 20 23:75 -52 19
10 Pärnu JK Vaprus, Estland Pärnu JK Vaprus 27 2 2 23 20:111 -91 8
  Champions League Quali.
  Abstieg

# Pärnu Linnameskond wurde am 11. Januar 2017 aufgelöst. Die Erstligalizenz ging an Pärnu JK Vaprus.

# JK Sillamäe Kalev steht am Ende der Saison 2017 als einziger Absteiger durch Lizenzentzug fest.