# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Levadia, Estland FC Levadia 3 2 1 0 13:1 12 7
2 JK Nõmme Kalju, Estland JK Nõmme Kalju 3 2 1 0 9:4 5 7
3 FC Infonet, Estland FC Infonet 3 2 0 1 7:3 4 6
4 FC Flora, Estland FC Flora 3 1 2 0 4:2 2 5
  JK Tammeka, Estland JK Tammeka 3 1 2 0 4:2 2 5
6 JK Narva Trans, Estland JK Narva Trans 3 1 1 1 7:4 3 4
7 Tulevik Viljandi, Estland Tulevik Viljandi 3 1 0 2 3:8 -5 3
8 Paide Linnameeskond, Estland Paide Linnameeskond 3 1 0 2 4:14 -10 3
9 Pärnu JK Vaprus, Estland Pärnu JK Vaprus 3 0 1 2 3:9 -6 1
10 JK Sillamäe Kalev, Estland JK Sillamäe Kalev 3 0 0 3 1:8 -7 0
  Champions League Quali.
  Abstieg

# Pärnu Linnameskond wurde am 11. Januar 2017 aufgelöst. Die Erstligalizenz ging an Pärnu JK Vaprus.

# JK Sillamäe Kalev steht am Ende der Saison 2017 als einziger Absteiger durch Lizenzentzug fest.