# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 1. FC Lok Leipzig, Deutschland 1. FC Lok Leipzig 16 12 4 0 44:9 35 40
2 Inter Leipzig, Deutschland Inter Leipzig 16 10 3 3 39:17 22 33
3 Bischofswerdaer FV, Deutschland Bischofswerdaer FV 16 8 5 3 28:18 10 29
4 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 16 9 1 6 38:32 6 28
5 SSV Markranstädt, Deutschland SSV Markranstädt 16 8 3 5 28:23 5 27
6 FC Carl Zeiss Jena II, Deutschland FC Carl Zeiss Jena II 16 8 2 6 40:26 14 26
7 FC Einheit Rudolstadt, Deutschland FC Einheit Rudolstadt 16 7 5 4 25:17 8 26
8 Union Sandersdorf, Deutschland Union Sandersdorf 16 7 4 5 31:25 6 25
9 VfL Halle 96, Deutschland VfL Halle 96 16 7 3 6 32:22 10 24
10 VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 16 5 4 7 23:38 -15 19
11 FSV Barleben, Deutschland FSV Barleben 16 5 3 8 20:26 -6 18
12 Askania Bernburg, Deutschland Askania Bernburg 16 4 5 7 19:24 -5 17
13 SV SCHOTT Jena, Deutschland SV SCHOTT Jena 16 5 1 10 23:36 -13 16
14 Rot-Weiß Erfurt II, Deutschland Rot-Weiß Erfurt II 16 3 6 7 16:26 -10 15
15 BSG Wismut Gera, Deutschland BSG Wismut Gera 16 2 3 11 17:42 -25 9
16 FC Eisenach, Deutschland FC Eisenach 16 1 2 13 12:54 -42 5
  Aufstieg
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger.

# Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz