# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 1. FC Lok Leipzig, Deutschland 1. FC Lok Leipzig 21 15 6 0 53:9 44 51
2 Inter Leipzig, Deutschland Inter Leipzig 21 13 4 4 48:21 27 43
3 Bischofswerdaer FV, Deutschland Bischofswerdaer FV 21 12 6 3 40:22 18 42
4 FC Carl Zeiss Jena II, Deutschland FC Carl Zeiss Jena II 21 10 5 6 53:32 21 35
5 SSV Markranstädt, Deutschland SSV Markranstädt 21 10 5 6 38:29 9 35
6 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 21 11 1 9 44:43 1 34
7 FC Einheit Rudolstadt, Deutschland FC Einheit Rudolstadt 21 9 6 6 31:22 9 33
8 Union Sandersdorf, Deutschland Union Sandersdorf 21 9 4 8 36:35 1 31
9 VfL Halle 96, Deutschland VfL Halle 96 21 8 4 9 45:35 10 28
10 FSV Barleben, Deutschland FSV Barleben 21 8 4 9 35:35 0 28
11 Askania Bernburg, Deutschland Askania Bernburg 21 6 6 9 26:31 -5 24
12 VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 21 6 5 10 35:52 -17 23
13 Rot-Weiß Erfurt II, Deutschland Rot-Weiß Erfurt II 21 5 6 10 30:43 -13 21
14 SV SCHOTT Jena, Deutschland SV SCHOTT Jena 21 6 2 13 30:54 -24 20
15 BSG Wismut Gera, Deutschland BSG Wismut Gera 21 3 4 14 24:50 -26 13
16 FC Eisenach, Deutschland FC Eisenach 21 2 2 17 14:69 -55 8
  Aufstieg
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger.

# Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz