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| 14.10.2016 | 19:00 | TSV Buchbach | - | SpVgg Bayreuth | 1:5 (0:1) | |
| 15.10.2016 | 14:00 | SV Seligenporten | - | TSV 1860 Rosenheim | 1:1 (0:0) | |
| 14:00 | SpVgg Bayern Hof | - | FC Augsburg II | 0:4 (0:1) | ||
| 14:00 | SpVgg Unterhaching | - | FC Ingolstadt 04 II | 5:1 (3:0) | ||
| 14:00 | Wacker Burghausen | - | TSV 1860 München II | 0:1 (0:0) | ||
| 14:00 | FV Illertissen | - | VfR Garching | 1:2 (0:2) | ||
| 14:00 | 1. FC Nürnberg II | - | FC Memmingen | 2:2 (1:1) | ||
| 14:00 | 1. FC Schweinfurt 05 | - | SpVgg Greuther Fürth II | 2:0 (2:0) | ||
| 14:00 | SV Schalding-Heining | - | Bayern München II | 2:2 (1:0) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
SpVgg Unterhaching | 15 | 13 | 2 | 0 | 46:9 | 37 | 41 |
| 2 |
|
VfR Garching | 15 | 8 | 2 | 5 | 30:26 | 4 | 26 |
| 3 |
|
FC Augsburg II | 15 | 6 | 7 | 2 | 33:17 | 16 | 25 |
| 4 |
|
Bayern München II | 15 | 6 | 7 | 2 | 21:15 | 6 | 25 |
| 5 |
|
1. FC Nürnberg II | 15 | 7 | 4 | 4 | 35:30 | 5 | 25 |
| 6 |
|
FC Memmingen | 15 | 5 | 6 | 4 | 28:22 | 6 | 21 |
| 7 |
|
SpVgg Bayreuth | 15 | 6 | 3 | 6 | 31:27 | 4 | 21 |
| 8 |
|
1. FC Schweinfurt 05 | 15 | 6 | 2 | 7 | 23:28 | -5 | 20 |
| 9 |
|
FV Illertissen | 15 | 6 | 2 | 7 | 21:26 | -5 | 20 |
| 10 |
|
SpVgg Greuther Fürth II | 15 | 5 | 4 | 6 | 22:21 | 1 | 19 |
| 11 |
|
TSV 1860 Rosenheim | 15 | 5 | 3 | 7 | 16:20 | -4 | 18 |
| 12 |
|
Wacker Burghausen | 15 | 4 | 5 | 6 | 22:25 | -3 | 17 |
| 13 |
|
SV Seligenporten | 15 | 4 | 4 | 7 | 20:37 | -17 | 16 |
| 14 |
|
FC Ingolstadt 04 II | 15 | 3 | 6 | 6 | 23:31 | -8 | 15 |
| 15 |
|
TSV Buchbach | 15 | 4 | 3 | 8 | 19:30 | -11 | 15 |
| 16 |
|
SV Schalding-Heining | 15 | 2 | 6 | 7 | 22:26 | -4 | 12 |
| 17 |
|
SpVgg Bayern Hof | 15 | 2 | 1 | 12 | 17:41 | -24 | 7 |
| 18 |
|
TSV 1860 München II | 15 | 8 | 3 | 4 | 0:0 | -8 | -36 |
| Playoffs | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Der TSV 1860 München II steigt gemäß den Statuten des Verbands automatisch in die Bayernliga ab, da die Profimannschaft des Vereins aus der 2. Bundesliga absteigt. Der SV Seligenporten vermeidet damit den direkten Abstieg und spielt in der Relegation, Schalding-Heining ist gerettet. |
