# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 1 1 0 0 2:0 2 3
  SV Wilhelmshaven, Deutschland SV Wilhelmshaven 1 1 0 0 2:0 2 3
  VfL Wolfsburg II, Deutschland VfL Wolfsburg II 1 1 0 0 2:0 2 3
4 Energie Cottbus II, Deutschland Energie Cottbus II 1 0 1 0 1:1 0 1
  VFC Plauen, Deutschland VFC Plauen 1 0 1 0 1:1 0 1
6 Sachsen Leipzig, Deutschland Sachsen Leipzig 1 0 1 0 0:0 0 1
7 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 0 0 0 0 0:0 0 0
  FC Oberneuland, Deutschland FC Oberneuland 0 0 0 0 0:0 0 0
  Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 0 0 0 0 0:0 0 0
  Hamburger SV II, Deutschland Hamburger SV II 0 0 0 0 0:0 0 0
  Hannover 96 II, Deutschland Hannover 96 II 0 0 0 0 0:0 0 0
  Hansa Rostock II, Deutschland Hansa Rostock II 0 0 0 0 0:0 0 0
  Hertha BSC II, Deutschland Hertha BSC II 0 0 0 0 0:0 0 0
  Holstein Kiel, Deutschland Holstein Kiel 0 0 0 0 0:0 0 0
  SV Babelsberg 03, Deutschland SV Babelsberg 03 0 0 0 0 0:0 0 0
16 Altona 93, Deutschland Altona 93 1 0 0 1 1:2 -1 0
17 VfB Lübeck, Deutschland VfB Lübeck 1 0 0 1 0:1 -1 0
18 Türkiyemspor Berlin, Deutschland Türkiyemspor Berlin 1 0 0 1 1:3 -2 0
  Aufstieg
  Abstieg

# Sachsen Leipzig hat am 4. März 2009 einen Insolvenzantrag gestellt. Der Verein steht damit als erster Absteiger aus der Regionalliga Nord fest.

# Altona 93 erhält keine Lizenz für die Saison 2009/2010 und steht damit als Absteiger fest.

# Türkiyemspor Berlin hält trotz Rang 15 die Klasse, da Kickes Emden nach dem Lizenzrückzug für die 3. Liga in der Saison 2009/2010 in der Oberliga startet.