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| 02.12.2016 | 19:00 | SV Babelsberg 03 | - | FSV 63 Luckenwalde | 2:0 (1:0) | |
| 19:00 | FC Viktoria 1889 Berlin | - | FC Carl Zeiss Jena | 2:2 (1:0) | ||
| 03.12.2016 | 13:30 | BFC Dynamo | - | FSV Budissa Bautzen | 1:2 (1:1) | |
| 04.12.2016 | 13:30 | ZFC Meuselwitz | - | VfB Auerbach | 3:1 (1:0) | |
| 13:30 | FC Schönberg 95 | - | Union Fürstenwalde | 4:1 (1:1) | ||
| 13:30 | RB Leipzig II | - | TSG Neustrelitz | 1:4 (1:1) | ||
| 13:30 | 1. FC Lok Leipzig | - | Berliner AK 07 | 1:4 (1:2) | ||
| 13:30 | Wacker Nordhausen | - | Energie Cottbus | 0:0 (0:0) | ||
| 26.03.2017 | 13:00 | FC Oberlausitz | - | Hertha BSC II | 2:0 (1:0) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FC Carl Zeiss Jena | 16 | 12 | 3 | 1 | 31:6 | 25 | 39 |
| 2 |
|
Berliner AK 07 | 16 | 10 | 3 | 3 | 27:16 | 11 | 33 |
| 3 |
|
Energie Cottbus | 16 | 9 | 5 | 2 | 24:8 | 16 | 32 |
| 4 |
|
BFC Dynamo | 16 | 7 | 5 | 4 | 30:17 | 13 | 26 |
| 5 |
|
FC Oberlausitz | 16 | 8 | 2 | 6 | 23:12 | 11 | 26 |
| 6 |
|
RB Leipzig II | 16 | 7 | 5 | 4 | 21:18 | 3 | 26 |
| 7 |
|
FC Viktoria 1889 Berlin | 16 | 6 | 7 | 3 | 31:21 | 10 | 25 |
| 8 |
|
SV Babelsberg 03 | 16 | 7 | 4 | 5 | 27:23 | 4 | 25 |
| 9 |
|
Hertha BSC II | 16 | 7 | 4 | 5 | 20:21 | -1 | 25 |
| 10 |
|
Wacker Nordhausen | 16 | 6 | 5 | 5 | 24:23 | 1 | 23 |
| 11 |
|
1. FC Lok Leipzig | 16 | 6 | 5 | 5 | 23:22 | 1 | 23 |
| 12 |
|
FC Schönberg 95 | 16 | 5 | 4 | 7 | 24:31 | -7 | 19 |
| 13 |
|
VfB Auerbach | 16 | 4 | 5 | 7 | 17:29 | -12 | 17 |
| 14 |
|
ZFC Meuselwitz | 16 | 3 | 6 | 7 | 12:16 | -4 | 15 |
| 15 |
|
Union Fürstenwalde | 16 | 2 | 6 | 8 | 14:30 | -16 | 12 |
| 16 |
|
FSV Budissa Bautzen | 16 | 2 | 5 | 9 | 15:25 | -10 | 11 |
| 17 |
|
FSV 63 Luckenwalde | 16 | 2 | 5 | 9 | 12:29 | -17 | 11 |
| 18 |
|
TSG Neustrelitz | 16 | 1 | 1 | 14 | 15:43 | -28 | 4 |
| Playoffs | |
| Abstieg | |
| Abstieg |
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# Der FC Schönberg 95 gab am 04. April bekannt, dass er aus finanziellen Gründen keine Lizenz für die neue Regionalliga-Saison beantragen wird. Zudem zieht RB Leipzig zum Saisonende seine zweite Mannschaft vom Spielbetrieb zurück. |
