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| 29.09.2016 | 17:00 | FC Carl Zeiss Jena | - | Energie Cottbus | 0:0 (0:0) | |
| 30.09.2016 | 18:30 | TSG Neustrelitz | - | Berliner AK 07 | 0:3 (0:3) | |
| 19:00 | SV Babelsberg 03 | - | FC Schönberg 95 | 0:0 (0:0) | ||
| 19:00 | VfB Auerbach | - | Wacker Nordhausen | 0:3 (0:0) | ||
| 02.10.2016 | 13:00 | FSV Budissa Bautzen | - | FSV 63 Luckenwalde | 2:2 (0:1) | |
| 13:30 | ZFC Meuselwitz | - | FC Oberlausitz | 0:1 (0:0) | ||
| 13:30 | FC Viktoria 1889 Berlin | - | RB Leipzig II | 1:0 (0:0) | ||
| 13:30 | Union Fürstenwalde | - | Hertha BSC II | 1:1 (0:1) | ||
| 14:05 | BFC Dynamo | - | 1. FC Lok Leipzig | 0:0 (0:0) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
FC Carl Zeiss Jena | 9 | 8 | 1 | 0 | 22:1 | 21 | 25 |
| 2 |
|
RB Leipzig II | 9 | 5 | 2 | 2 | 12:8 | 4 | 17 |
| 3 |
|
Hertha BSC II | 9 | 5 | 2 | 2 | 14:11 | 3 | 17 |
| 4 |
|
FC Viktoria 1889 Berlin | 9 | 4 | 4 | 1 | 18:8 | 10 | 16 |
| 5 |
|
Energie Cottbus | 9 | 4 | 4 | 1 | 11:5 | 6 | 16 |
| 6 |
|
BFC Dynamo | 9 | 4 | 3 | 2 | 17:7 | 10 | 15 |
| 7 |
|
1. FC Lok Leipzig | 9 | 4 | 3 | 2 | 13:8 | 5 | 15 |
| 8 |
|
SV Babelsberg 03 | 9 | 4 | 3 | 2 | 16:13 | 3 | 15 |
| 9 |
|
Berliner AK 07 | 9 | 4 | 3 | 2 | 13:11 | 2 | 15 |
| 10 |
|
Wacker Nordhausen | 9 | 4 | 1 | 4 | 14:14 | 0 | 13 |
| 11 |
|
FC Oberlausitz | 9 | 4 | 0 | 5 | 14:11 | 3 | 12 |
| 12 |
|
FC Schönberg 95 | 9 | 3 | 2 | 4 | 11:16 | -5 | 11 |
| 13 |
|
Union Fürstenwalde | 9 | 2 | 4 | 3 | 8:15 | -7 | 10 |
| 14 |
|
VfB Auerbach | 9 | 2 | 2 | 5 | 6:17 | -11 | 8 |
| 15 |
|
FSV Budissa Bautzen | 9 | 1 | 2 | 6 | 10:16 | -6 | 5 |
| 16 |
|
FSV 63 Luckenwalde | 9 | 0 | 5 | 4 | 8:21 | -13 | 5 |
| 17 |
|
ZFC Meuselwitz | 9 | 0 | 4 | 5 | 3:10 | -7 | 4 |
| 18 |
|
TSG Neustrelitz | 9 | 0 | 1 | 8 | 6:24 | -18 | 1 |
| Playoffs | |
| Abstieg | |
| Abstieg |
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# Der FC Schönberg 95 gab am 04. April bekannt, dass er aus finanziellen Gründen keine Lizenz für die neue Regionalliga-Saison beantragen wird. Zudem zieht RB Leipzig zum Saisonende seine zweite Mannschaft vom Spielbetrieb zurück. |
