Freundschaft Vereine   Sp. S U N Tore
  Auswärts 1 0 0 1 0 : 6
  1 0 0 1 0 : 6
3. Liga   Sp. S U N Tore
  Zu Hause 3 2 1 0 4 : 1
  Auswärts 3 0 1 2 2 : 6
  6 2 2 2 6 : 7
Regionalliga Bayern   Sp. S U N Tore
  Zu Hause 8 4 4 0 18 : 9
  Auswärts 8 1 1 6 11 : 23
  16 5 5 6 29 : 32
Regionalliga Süd (1994-2012)   Sp. S U N Tore
  Zu Hause 8 3 4 1 14 : 8
  Auswärts 8 1 4 3 7 : 11
  16 4 8 4 21 : 19
GESAMT   Sp. S U N Tore
  Zu Hause 19 9 9 1 36 : 18
  Auswärts 20 2 6 12 20 : 46
  Neutraler Ort 0 0 0 0 0 : 0
  39 11 15 13 56 : 64
Freundschaft Vereine
2019 Kalenderwoche Bayern München II - Wacker Burghausen 6:0 (2:0)
3. Liga
2010/2011 20. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 2:0 (1:0)
2010/2011 2. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 1:1 (0:0)
2009/2010 35. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 2:0 (1:0)
2009/2010 16. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 2:1 (2:1)
2008/2009 36. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 3:1 (0:0)
2008/2009 17. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 0:0 (0:0)
Regionalliga Bayern
2023/2024 18. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 4:1 (1:0)
2023/2024 1. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 3:3 (1:2)
2022/2023 31. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 3:1 (1:0)
2022/2023 12. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 5:0 (1:0)
2021/2022 37. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 0:4 (0:1)
2021/2022 18. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 2:2 (1:2)
2018/2019 34. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 2:1 (1:0)
2018/2019 17. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 2:1 (2:1)
2017/2018 32. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 5:0 (2:0)
2017/2018 13. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 3:1 (0:1)
2016/2017 30. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 2:2 (1:1)
2016/2017 3. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 2:2 (0:1)
2015/2016 23. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 1:0 (1:0)
2015/2016 6. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 3:2 (2:0)
2014/2015 19. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 4:0 (2:0)
2014/2015 2. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 0:0 (0:0)
Regionalliga Süd (1994-2012)
2007/2008 33. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 3:1 (2:1)
2007/2008 16. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 1:1 (0:1)
2001/2002 22. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 1:1 (1:1)
2001/2002 5. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 1:2 (1:1)
2000/2001 30. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 3:3 (1:1)
2000/2001 13. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 3:1 (2:0)
1999/2000 19. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 2:0 (1:0)
1999/2000 2. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 1:1 (0:0)
1998/1999 30. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 0:0 (0:0)
1998/1999 13. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 2:1
1997/1998 34. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 1:2
1997/1998 17. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 1:1
1996/1997 26. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 3:0
1996/1997 9. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 2:0
1995/1996 21. Spieltag Bayern München II - Wacker Burghausen 0:0
1995/1996 4. Spieltag Wacker Burghausen - Bayern München II 1:1

Für Spiele, die im Elfmeterschießen entschieden wurden, geht der Spielstand nach 120 Minuten in diese Wertung ein.