Gruppe 1
21.07.2016 02:00 Club León - Club Celaya 1:1
27.07.2016 04:00 Atlante - Club León 0:1
10.08.2016 02:00 Club Celaya - Atlante 1:1
18.08.2016 02:00 Club Celaya - Club León 1:1
24.08.2016 02:00 Club León - Atlante 1:3
14.09.2016 02:00 Atlante - Club Celaya 2:2
Gruppe 2
21.07.2016 04:00 Chiapas FC - Cafetaleros de Tapachula 1:1
27.07.2016 02:00 Deportivo Guadalajara - Chiapas FC 1:4
11.08.2016 03:30 Cafetaleros de Tapachula - Deportivo Guadalajara 0:0
18.08.2016 02:00 Cafetaleros de Tapachula - Chiapas FC 1:1
25.08.2016 04:00 Deportivo Guadalajara - Cafetaleros de Tapachula 1:0
15.09.2016 02:00 Chiapas FC - Deportivo Guadalajara 2:2
Gruppe 3
20.07.2016 04:00 Cruz Azul - Deportivo Tepic 2:0
28.07.2016 03:30 Leones Negros - Cruz Azul 2:2
10.08.2016 04:00 Deportivo Tepic - Leones Negros 1:0
18.08.2016 03:30 Deportivo Tepic - Cruz Azul 1:4 (1:2)
24.08.2016 04:00 Cruz Azul - Leones Negros 3:1
15.09.2016 04:00 Leones Negros - Deportivo Tepic 5:0
Gruppe 4
20.07.2016 02:00 Alebrijes de Oaxaca - Murciélagos FC 0:0
28.07.2016 02:00 Monarcas Morelia - Alebrijes de Oaxaca 3:0
10.08.2016 04:00 Murciélagos FC - Monarcas Morelia 1:1
17.08.2016 04:00 Murciélagos FC - Alebrijes de Oaxaca 0:0
25.08.2016 02:00 Alebrijes de Oaxaca - Monarcas Morelia 2:1
14.09.2016 02:00 Monarcas Morelia - Murciélagos FC 4:0
Gruppe 5
21.07.2016 03:30 Venados FC - CF América 0:3
27.07.2016 04:00 CF América - Mineros de Zacatecas 4:1
10.08.2016 04:00 Mineros de Zacatecas - Venados FC 3:0
17.08.2016 04:00 CF América - Venados FC 2:0
25.08.2016 03:30 Mineros de Zacatecas - CF América 0:2
14.09.2016 03:30 Venados FC - Mineros de Zacatecas 4:4
Gruppe 6
20.07.2016 04:00 Club Tijuana - Deportivo Toluca 3:0
27.07.2016 02:00 Lobos BUAP - Club Tijuana 4:0
10.08.2016 02:00 Lobos BUAP - Deportivo Toluca 1:1
18.08.2016 04:00 Club Tijuana - Lobos BUAP 1:1
24.08.2016 02:00 Deportivo Toluca - Lobos BUAP 4:0
15.09.2016 03:30 Deportivo Toluca - Club Tijuana 2:1
Gruppe 7
20.07.2016 02:00 FC Juárez - CD Veracruz 5:0
28.07.2016 04:00 Santos Laguna - FC Juárez 1:1
11.08.2016 04:00 CD Veracruz - Santos Laguna 4:1
17.08.2016 04:00 CD Veracruz - FC Juárez 1:2
25.08.2016 04:00 FC Juárez - Santos Laguna 3:3
14.09.2016 04:30 Santos Laguna - CD Veracruz 1:1
Gruppe 8
21.07.2016 02:00 Gallos Blancos - Puebla FC 1:2
28.07.2016 04:00 Dorados de Sinaloa - Gallos Blancos 1:2
11.08.2016 02:00 Puebla FC - Dorados de Sinaloa 2:1
17.08.2016 02:00 Gallos Blancos - Dorados de Sinaloa 2:0
24.08.2016 02:00 Puebla FC - Gallos Blancos 1:1
14.09.2016 02:30 Dorados de Sinaloa - Puebla FC 0:1
Achtelfinale
28.09.2016 02:00 Puebla FC - Leones Negros 3:2 (1:1)
02:00 Chiapas FC - Atlante 2:1 (2:0)
04:00 Cruz Azul - Mineros de Zacatecas 4:0 (2:0)
04:00 Monarcas Morelia - Deportivo Guadalajara 0:1 (0:1)
29.09.2016 02:00 Deportivo Toluca - Club León 4:3 (0:1)
02:00 Gallos Blancos - Lobos BUAP 3:1 (1:1)
04:00 CF América - CD Veracruz 1:0 (1:0)
04:00 FC Juárez - Alebrijes de Oaxaca 3:5 (0:0, 1:1) i.E.
Viertelfinale
19.10.2016 03:30 CF América - Chiapas FC 3:2 (2:0)
20.10.2016 02:00 Cruz Azul - Gallos Blancos 1:3 (1:1)
04:00 Puebla FC - Deportivo Toluca 0:2 (0:0)
04:00 Deportivo Guadalajara - Alebrijes de Oaxaca 1:0 (1:0)
Halbfinale
26.10.2016 04:00 Deportivo Toluca - Gallos Blancos 7:8 (0:0, 0:0) i.E.
27.10.2016 04:00 CF América - Deportivo Guadalajara 3:4 (1:0, 1:1) i.E.
Finale
03.11.2016 03:00 Gallos Blancos - Deportivo Guadalajara 3:2 (0:0, 0:0) i.E.