1. Spieltag 15.08.1998 VfL Wolfsburg - Bayern München 0:1
2. Spieltag 22.08.1998 Bayern München - MSV Duisburg 3:1
3. Spieltag 09.09.1998 Bayern München - Hansa Rostock 6:1
4. Spieltag 12.09.1998 SC Freiburg - Bayern München 0:2
5. Spieltag 20.09.1998 Bayern München - Hamburger SV 5:3 gelbe Karte
6. Spieltag 26.09.1998 Werder Bremen - Bayern München 0:1
7. Spieltag 04.10.1998 Bayern München - Borussia Dortmund 2:2
8. Spieltag 17.10.1998 FC Schalke 04 - Bayern München 1:3
9. Spieltag 24.10.1998 Bayern München - 1. FC Kaiserslautern 4:0
10. Spieltag 31.10.1998 Eintracht Frankfurt - Bayern München 1:0
11. Spieltag 07.11.1998 Bayern München - TSV 1860 München 3:1
13. Spieltag 14.11.1998 Bayern München - VfB Stuttgart 2:0
14. Spieltag 21.11.1998 Hertha BSC - Bayern München 1:0 gelbe Karte
15. Spieltag 28.11.1998 Bayern München - 1. FC Nürnberg 2:0
16. Spieltag 04.12.1998 VfL Bochum - Bayern München 2:2
17. Spieltag 13.12.1998 Bayern München - Bayer Leverkusen 2:0
12. Spieltag 16.12.1998 Bor. Mönchengladbach - Bayern München 0:2
18. Spieltag 19.12.1998 Bayern München - VfL Wolfsburg 3:0
19. Spieltag 20.02.1999 MSV Duisburg - Bayern München 0:3
20. Spieltag 27.02.1999 Hansa Rostock - Bayern München 0:4
21. Spieltag 06.03.1999 Bayern München - SC Freiburg 2:0
22. Spieltag 13.03.1999 Hamburger SV - Bayern München 0:2
23. Spieltag 20.03.1999 Bayern München - Werder Bremen 1:0
24. Spieltag 03.04.1999 Borussia Dortmund - Bayern München 2:2
25. Spieltag 10.04.1999 Bayern München - FC Schalke 04 1:1
26. Spieltag 13.04.1999 1. FC Kaiserslautern - Bayern München 2:1
28. Spieltag 25.04.1999 TSV 1860 München - Bayern München 1:1
29. Spieltag 01.05.1999 Bayern München - Bor. Mönchengladbach 4:2 gelb-rote Karte
31. Spieltag 09.05.1999 Bayern München - Hertha BSC 1:1
33. Spieltag 22.05.1999 Bayern München - VfL Bochum 4:2