1. Spieltag 17.07.2016 TSV 1860 Rosenheim - SpVgg Unterhaching 1:2
2. Spieltag 23.07.2016 SpVgg Unterhaching - VfR Garching 5:1
3. Spieltag 29.07.2016 FC Memmingen - SpVgg Unterhaching 1:3
4. Spieltag 02.08.2016 SpVgg Unterhaching - SpVgg Greuther Fürth II 2:0 Tor
6. Spieltag 12.08.2016 SpVgg Unterhaching - FC Augsburg II 3:1 Tor
7. Spieltag 16.08.2016 SV Schalding-Heining - SpVgg Unterhaching 0:1 Tor
8. Spieltag 27.08.2016 SpVgg Unterhaching - 1. FC Schweinfurt 05 5:0
9. Spieltag 03.09.2016 1. FC Nürnberg II - SpVgg Unterhaching 1:4 Tor
10. Spieltag 10.09.2016 SpVgg Unterhaching - FV Illertissen 5:0 TorTorTor
11. Spieltag 16.09.2016 SV Seligenporten - SpVgg Unterhaching 0:0
5. Spieltag 20.09.2016 Bayern München II - SpVgg Unterhaching 2:2 Tor
12. Spieltag 24.09.2016 SpVgg Unterhaching - Wacker Burghausen 2:0
13. Spieltag 30.09.2016 TSV Buchbach - SpVgg Unterhaching 0:3
14. Spieltag 08.10.2016 SpVgg Unterhaching - SpVgg Bayern Hof 4:1 Tor
15. Spieltag 15.10.2016 SpVgg Unterhaching - FC Ingolstadt 04 II 5:1 TorTor
16. Spieltag 21.10.2016 SpVgg Bayreuth - SpVgg Unterhaching 0:4 gelbe Karte
17. Spieltag 29.10.2016 SpVgg Unterhaching - TSV 1860 München II 0:0
18. Spieltag 05.11.2016 SpVgg Unterhaching - TSV 1860 Rosenheim 4:0
19. Spieltag 13.11.2016 VfR Garching - SpVgg Unterhaching 1:8
20. Spieltag 19.11.2016 SpVgg Greuther Fürth II - SpVgg Unterhaching 0:3 Tor
21. Spieltag 27.11.2016 SpVgg Unterhaching - Bayern München II 2:1 Tor
22. Spieltag 04.03.2017 FC Augsburg II - SpVgg Unterhaching 0:1
23. Spieltag 11.03.2017 SpVgg Unterhaching - SV Schalding-Heining 0:0
24. Spieltag 18.03.2017 SpVgg Unterhaching - 1. FC Nürnberg II 0:0
25. Spieltag 24.03.2017 1. FC Schweinfurt 05 - SpVgg Unterhaching 2:1
26. Spieltag 01.04.2017 FV Illertissen - SpVgg Unterhaching 3:3 gelbe Karte
27. Spieltag 08.04.2017 SpVgg Unterhaching - SV Seligenporten 1:1 Tor
29. Spieltag 17.04.2017 SpVgg Unterhaching - TSV Buchbach 5:0 TorTor
30. Spieltag 22.04.2017 SpVgg Unterhaching - FC Memmingen 2:1
31. Spieltag 28.04.2017 SpVgg Bayern Hof - SpVgg Unterhaching 2:4 Tor
28. Spieltag 01.05.2017 Wacker Burghausen - SpVgg Unterhaching 0:1
32. Spieltag 05.05.2017 FC Ingolstadt 04 II - SpVgg Unterhaching 2:2
33. Spieltag 13.05.2017 SpVgg Unterhaching - SpVgg Bayreuth 5:1 TorTor
34. Spieltag 19.05.2017 TSV 1860 München II - SpVgg Unterhaching 0:3