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| 07.04.2006 | 19:00 | Eintracht Braunschweig | - | Alemannia Aachen | 0:1 (0:1) | |
| 19:00 | VfL Bochum | - | Sportfreunde Siegen | 3:1 (2:0) | ||
| 19:00 | Kickers Offenbach | - | Erzgebirge Aue | 2:1 (0:0) | ||
| 09.04.2006 | 15:00 | SC Freiburg | - | SC Paderborn 07 | 1:0 (1:0) | |
| 15:00 | LR Ahlen | - | Energie Cottbus | 0:1 (0:0) | ||
| 15:00 | Hansa Rostock | - | 1. FC Saarbrücken | 3:0 (3:0) | ||
| 15:00 | SpVgg Greuther Fürth | - | SpVgg Unterhaching | 2:0 (2:0) | ||
| 15:00 | TSV 1860 München | - | Wacker Burghausen | 1:1 (0:0) | ||
| 10.04.2006 | 20:15 | Dynamo Dresden | - | Karlsruher SC | 3:2 (2:1) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
Alemannia Aachen | 29 | 19 | 4 | 6 | 56:29 | 27 | 61 |
| 2 |
|
VfL Bochum | 29 | 17 | 8 | 4 | 49:21 | 28 | 59 |
| 3 |
|
Energie Cottbus | 29 | 14 | 8 | 7 | 43:29 | 14 | 50 |
| 4 |
|
SpVgg Greuther Fürth | 29 | 13 | 8 | 8 | 46:38 | 8 | 47 |
| 5 |
|
Karlsruher SC | 29 | 13 | 7 | 9 | 42:37 | 5 | 46 |
| 6 |
|
SC Freiburg | 29 | 13 | 6 | 10 | 35:30 | 5 | 45 |
| 7 |
|
Hansa Rostock | 29 | 13 | 4 | 12 | 41:38 | 3 | 43 |
| 8 |
|
Wacker Burghausen | 29 | 10 | 10 | 9 | 35:42 | -7 | 40 |
| 9 |
|
Erzgebirge Aue | 29 | 10 | 9 | 10 | 32:33 | -1 | 39 |
| 10 |
|
SC Paderborn 07 | 29 | 10 | 7 | 12 | 37:30 | 7 | 37 |
| 11 |
|
SpVgg Unterhaching | 29 | 11 | 4 | 14 | 39:40 | -1 | 37 |
| 12 |
|
Eintracht Braunschweig | 29 | 11 | 4 | 14 | 32:37 | -5 | 37 |
| 13 |
|
TSV 1860 München | 29 | 9 | 9 | 11 | 37:37 | 0 | 36 |
| 14 |
|
Kickers Offenbach | 29 | 9 | 6 | 14 | 31:50 | -19 | 33 |
| 15 |
|
1. FC Saarbrücken | 29 | 9 | 5 | 15 | 34:56 | -22 | 32 |
| 16 |
|
Dynamo Dresden | 29 | 8 | 6 | 15 | 30:42 | -12 | 30 |
| 17 |
|
LR Ahlen | 29 | 7 | 7 | 15 | 31:44 | -13 | 28 |
| 18 |
|
Sportfreunde Siegen | 29 | 6 | 6 | 17 | 29:46 | -17 | 24 |
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# Das Spiel Wacker Burghausen - 1860 München (12. Spieltag, 0:2) wird wiederholt. |
