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| 09.11.2012 | 18:00 | 1. FC Köln | - | MSV Duisburg | 0:0 (0:0) | |
| 18:00 | Erzgebirge Aue | - | Eintracht Braunschweig | 1:1 (0:1) | ||
| 18:00 | SV Sandhausen | - | Hertha BSC | 1:6 (0:2) | ||
| 10.11.2012 | 13:00 | SC Paderborn 07 | - | 1. FC Kaiserslautern | 1:1 (0:0) | |
| 13:00 | 1. FC Union Berlin | - | VfR Aalen | 0:0 (0:0) | ||
| 11.11.2012 | 13:30 | FC Ingolstadt 04 | - | Jahn Regensburg | 4:2 (0:1) | |
| 13:30 | FSV Frankfurt | - | TSV 1860 München | 0:1 (0:1) | ||
| 13:30 | Energie Cottbus | - | Dynamo Dresden | 2:0 (2:0) | ||
| 12.11.2012 | 20:15 | FC St. Pauli | - | VfL Bochum | 1:1 (1:0) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
Eintracht Braunschweig | 13 | 9 | 4 | 0 | 22:6 | 16 | 31 |
| 2 |
|
Hertha BSC | 13 | 7 | 5 | 1 | 25:12 | 13 | 26 |
| 3 |
|
1. FC Kaiserslautern | 13 | 6 | 7 | 0 | 26:16 | 10 | 25 |
| 4 |
|
Energie Cottbus | 13 | 7 | 4 | 2 | 20:12 | 8 | 25 |
| 5 |
|
FC Ingolstadt 04 | 13 | 6 | 5 | 2 | 19:13 | 6 | 23 |
| 6 |
|
FSV Frankfurt | 13 | 6 | 3 | 4 | 18:15 | 3 | 21 |
| 7 |
|
TSV 1860 München | 13 | 5 | 5 | 3 | 15:10 | 5 | 20 |
| 8 |
|
VfR Aalen | 13 | 6 | 2 | 5 | 15:12 | 3 | 20 |
| 9 |
|
SC Paderborn 07 | 13 | 5 | 4 | 4 | 20:14 | 6 | 19 |
| 10 |
|
1. FC Union Berlin | 13 | 4 | 4 | 5 | 16:16 | 0 | 16 |
| 11 |
|
FC St. Pauli | 13 | 3 | 6 | 4 | 13:16 | -3 | 15 |
| 12 |
|
1. FC Köln | 13 | 3 | 5 | 5 | 13:17 | -4 | 14 |
| 13 |
|
Erzgebirge Aue | 13 | 3 | 4 | 6 | 16:19 | -3 | 13 |
| 14 |
|
VfL Bochum | 13 | 2 | 5 | 6 | 9:23 | -14 | 11 |
| 15 |
|
Dynamo Dresden | 13 | 2 | 3 | 8 | 14:22 | -8 | 9 |
|
Jahn Regensburg | 13 | 3 | 0 | 10 | 14:22 | -8 | 9 | |
| 17 |
|
MSV Duisburg | 13 | 2 | 3 | 8 | 9:23 | -14 | 9 |
| 18 |
|
SV Sandhausen | 13 | 2 | 3 | 8 | 11:27 | -16 | 9 |
| Aufstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Am 19.6. wurde endgültig entschieden, dass der MSV Duisburg keine Lizenz für die Zweitligasaison 2013/2014 erhält. Der sportlich abgestiegene SV Sandhausen bleibt damit eine weitere Saison in der 2. Bundesliga. |
