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| 23.11.2012 | 18:00 | 1. FC Köln | - | VfL Bochum | 3:1 (2:0) | |
| 18:00 | SC Paderborn 07 | - | Dynamo Dresden | 2:2 (2:2) | ||
| 18:00 | Jahn Regensburg | - | VfR Aalen | 1:3 (1:0) | ||
| 24.11.2012 | 13:00 | 1. FC Union Berlin | - | TSV 1860 München | 2:2 (1:0) | |
| 13:00 | FSV Frankfurt | - | 1. FC Kaiserslautern | 0:1 (0:1) | ||
| 13:00 | Energie Cottbus | - | Eintracht Braunschweig | 3:1 (2:1) | ||
| 25.11.2012 | 13:30 | FC St. Pauli | - | MSV Duisburg | 4:1 (1:1) | |
| 13:30 | FC Ingolstadt 04 | - | SV Sandhausen | 1:1 (1:0) | ||
| 13:30 | Erzgebirge Aue | - | Hertha BSC | 0:4 (0:2) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
Eintracht Braunschweig | 15 | 10 | 4 | 1 | 26:9 | 17 | 34 |
| 2 |
|
Hertha BSC | 15 | 9 | 5 | 1 | 30:12 | 18 | 32 |
| 3 |
|
1. FC Kaiserslautern | 15 | 8 | 7 | 0 | 28:16 | 12 | 31 |
| 4 |
|
Energie Cottbus | 15 | 8 | 4 | 3 | 23:14 | 9 | 28 |
| 5 |
|
FC Ingolstadt 04 | 15 | 6 | 6 | 3 | 20:17 | 3 | 24 |
| 6 |
|
SC Paderborn 07 | 15 | 6 | 5 | 4 | 23:16 | 7 | 23 |
| 7 |
|
VfR Aalen | 15 | 7 | 2 | 6 | 18:14 | 4 | 23 |
| 8 |
|
TSV 1860 München | 15 | 5 | 6 | 4 | 17:14 | 3 | 21 |
| 9 |
|
FSV Frankfurt | 15 | 6 | 3 | 6 | 19:18 | 1 | 21 |
| 10 |
|
1. FC Köln | 15 | 5 | 5 | 5 | 18:18 | 0 | 20 |
| 11 |
|
1. FC Union Berlin | 15 | 4 | 6 | 5 | 21:21 | 0 | 18 |
| 12 |
|
FC St. Pauli | 15 | 4 | 6 | 5 | 17:18 | -1 | 18 |
| 13 |
|
VfL Bochum | 15 | 3 | 5 | 7 | 15:28 | -13 | 14 |
| 14 |
|
Dynamo Dresden | 15 | 3 | 4 | 8 | 18:25 | -7 | 13 |
| 15 |
|
Erzgebirge Aue | 15 | 3 | 4 | 8 | 17:25 | -8 | 13 |
| 16 |
|
MSV Duisburg | 15 | 3 | 3 | 9 | 12:28 | -16 | 12 |
| 17 |
|
Jahn Regensburg | 15 | 3 | 1 | 11 | 18:28 | -10 | 10 |
| 18 |
|
SV Sandhausen | 15 | 2 | 4 | 9 | 14:33 | -19 | 10 |
| Aufstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Am 19.6. wurde endgültig entschieden, dass der MSV Duisburg keine Lizenz für die Zweitligasaison 2013/2014 erhält. Der sportlich abgestiegene SV Sandhausen bleibt damit eine weitere Saison in der 2. Bundesliga. |
