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| 15.02.2013 | 18:00 | Jahn Regensburg | - | Eintracht Braunschweig | 0:1 (0:1) | |
| 18:00 | TSV 1860 München | - | VfL Bochum | 0:1 (0:1) | ||
| 18:00 | SC Paderborn 07 | - | Erzgebirge Aue | 2:0 (2:0) | ||
| 16.02.2013 | 13:00 | VfR Aalen | - | Hertha BSC | 0:1 (0:0) | |
| 13:00 | 1. FC Union Berlin | - | FC Ingolstadt 04 | 1:1 (0:0) | ||
| 17.02.2013 | 13:30 | MSV Duisburg | - | 1. FC Kaiserslautern | 0:0 (0:0) | |
| 13:30 | FSV Frankfurt | - | Energie Cottbus | 1:0 (1:0) | ||
| 13:30 | Dynamo Dresden | - | SV Sandhausen | 3:1 (1:0) | ||
| 18.02.2013 | 20:15 | FC St. Pauli | - | 1. FC Köln | 0:1 (0:1) |
| » Tabelle | Heim | Auswärts | Hinrunde | Rückrunde | 1. Halbzeit | 2. Halbzeit |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
|
Eintracht Braunschweig | 22 | 15 | 6 | 1 | 39:17 | 22 | 51 |
| 2 |
|
Hertha BSC | 22 | 14 | 7 | 1 | 44:18 | 26 | 49 |
| 3 |
|
1. FC Kaiserslautern | 22 | 10 | 9 | 3 | 33:21 | 12 | 39 |
| 4 |
|
FSV Frankfurt | 22 | 10 | 3 | 9 | 30:26 | 4 | 33 |
| 5 |
|
1. FC Köln | 22 | 8 | 9 | 5 | 25:22 | 3 | 33 |
| 6 |
|
1. FC Union Berlin | 22 | 8 | 8 | 6 | 36:31 | 5 | 32 |
| 7 |
|
Energie Cottbus | 22 | 8 | 7 | 7 | 26:24 | 2 | 31 |
| 8 |
|
TSV 1860 München | 22 | 7 | 9 | 6 | 24:20 | 4 | 30 |
| 9 |
|
VfR Aalen | 22 | 8 | 6 | 8 | 23:20 | 3 | 30 |
| 10 |
|
FC Ingolstadt 04 | 22 | 7 | 9 | 6 | 26:25 | 1 | 30 |
| 11 |
|
SC Paderborn 07 | 22 | 8 | 5 | 9 | 29:27 | 2 | 29 |
| 12 |
|
VfL Bochum | 22 | 6 | 6 | 10 | 27:37 | -10 | 24 |
| 13 |
|
Erzgebirge Aue | 22 | 6 | 5 | 11 | 28:34 | -6 | 23 |
| 14 |
|
FC St. Pauli | 22 | 5 | 8 | 9 | 19:27 | -8 | 23 |
| 15 |
|
MSV Duisburg | 22 | 6 | 5 | 11 | 21:35 | -14 | 23 |
| 16 |
|
Dynamo Dresden | 22 | 4 | 8 | 10 | 22:33 | -11 | 20 |
| 17 |
|
SV Sandhausen | 22 | 4 | 6 | 12 | 26:46 | -20 | 18 |
| 18 |
|
Jahn Regensburg | 22 | 4 | 4 | 14 | 25:40 | -15 | 16 |
| Aufstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Am 19.6. wurde endgültig entschieden, dass der MSV Duisburg keine Lizenz für die Zweitligasaison 2013/2014 erhält. Der sportlich abgestiegene SV Sandhausen bleibt damit eine weitere Saison in der 2. Bundesliga. |
