# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SC Paderborn 07, Deutschland SC Paderborn 07 25 15 7 3 28:9 19 52
2 SV Wehen Wiesbaden, Deutschland SV Wehen Wiesbaden 25 11 10 4 24:8 16 43
3 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 25 10 10 5 27:13 14 40
4 Karlsruher SC, Deutschland Karlsruher SC 25 9 11 5 13:10 3 38
5 Hansa Rostock, Deutschland Hansa Rostock 25 9 10 6 14:10 4 37
6 SV Meppen, Deutschland SV Meppen 25 9 9 7 13:10 3 36
7 VfR Aalen, Deutschland VfR Aalen 25 8 11 6 15:12 3 35
8 FC Carl Zeiss Jena, Deutschland FC Carl Zeiss Jena 25 6 15 4 13:11 2 33
9 Fortuna Köln, Deutschland Fortuna Köln 25 6 14 5 16:14 2 32
10 FSV Zwickau, Deutschland FSV Zwickau 25 8 7 10 15:17 -2 31
11 VfL Osnabrück, Deutschland VfL Osnabrück 25 8 7 10 16:21 -5 31
12 Würzburger Kickers, Deutschland Würzburger Kickers 25 7 8 10 9:14 -5 29
13 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 25 6 11 8 14:20 -6 29
14 Werder Bremen II, Deutschland Werder Bremen II 25 5 14 6 11:17 -6 29
15 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 25 6 10 9 14:17 -3 28
16 Sportfreunde Lotte, Deutschland Sportfreunde Lotte 25 5 12 8 16:21 -5 27
17 Preußen Münster, Deutschland Preußen Münster 25 6 9 10 12:19 -7 27
18 SG Sonnenhof Großaspach, Deutschland SG Sonnenhof Großaspach 25 6 9 10 12:22 -10 27
19 SpVgg Unterhaching, Deutschland SpVgg Unterhaching 25 5 9 11 14:18 -4 24
20 Rot-Weiß Erfurt, Deutschland Rot-Weiß Erfurt 25 2 13 10 5:18 -13 19
  Aufstieg
  Relegation
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen.

# Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt.