# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SC Paderborn 07, Deutschland SC Paderborn 07 27 16 6 5 56:27 29 54
2 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 27 17 3 7 43:27 16 54
3 SV Wehen Wiesbaden, Deutschland SV Wehen Wiesbaden 27 15 5 7 56:24 32 50
4 Hansa Rostock, Deutschland Hansa Rostock 27 14 6 7 37:24 13 48
5 Karlsruher SC, Deutschland Karlsruher SC 27 13 9 5 30:20 10 48
6 Fortuna Köln, Deutschland Fortuna Köln 27 13 8 6 42:29 13 47
7 SpVgg Unterhaching, Deutschland SpVgg Unterhaching 27 13 3 11 41:39 2 42
8 SV Meppen, Deutschland SV Meppen 27 10 10 7 31:31 0 40
9 VfR Aalen, Deutschland VfR Aalen 27 10 9 8 39:35 4 39
10 Würzburger Kickers, Deutschland Würzburger Kickers 27 10 7 10 35:38 -3 37
11 SG Sonnenhof Großaspach, Deutschland SG Sonnenhof Großaspach 27 9 7 11 33:39 -6 34
12 VfL Osnabrück, Deutschland VfL Osnabrück 27 8 9 10 39:45 -6 33
13 FC Carl Zeiss Jena, Deutschland FC Carl Zeiss Jena 27 8 8 11 29:35 -6 32
14 FSV Zwickau, Deutschland FSV Zwickau 27 8 8 11 29:37 -8 32
15 Preußen Münster, Deutschland Preußen Münster 27 8 7 12 32:37 -5 31
16 Sportfreunde Lotte, Deutschland Sportfreunde Lotte 27 8 6 13 32:41 -9 30
17 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 27 7 8 12 34:41 -7 29
18 Werder Bremen II, Deutschland Werder Bremen II 27 3 10 14 25:46 -21 19
19 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 27 6 4 17 33:55 -22 13
20 Rot-Weiß Erfurt, Deutschland Rot-Weiß Erfurt 27 4 7 16 19:45 -26 9
  Aufstieg
  Relegation
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen.

# Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt.