# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SC Paderborn 07, Deutschland SC Paderborn 07 30 18 7 5 62:30 32 61
2 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 30 19 4 7 55:30 25 61
3 SV Wehen Wiesbaden, Deutschland SV Wehen Wiesbaden 30 18 5 7 66:28 38 59
4 Karlsruher SC, Deutschland Karlsruher SC 30 16 9 5 38:22 16 57
5 Fortuna Köln, Deutschland Fortuna Köln 30 15 8 7 48:32 16 53
6 Hansa Rostock, Deutschland Hansa Rostock 30 14 6 10 39:29 10 48
7 SpVgg Unterhaching, Deutschland SpVgg Unterhaching 30 14 5 11 46:43 3 47
8 VfR Aalen, Deutschland VfR Aalen 30 11 10 9 41:41 0 43
9 Würzburger Kickers, Deutschland Würzburger Kickers 30 12 7 11 40:42 -2 43
10 SV Meppen, Deutschland SV Meppen 30 10 12 8 34:36 -2 42
11 SG Sonnenhof Großaspach, Deutschland SG Sonnenhof Großaspach 30 10 7 13 38:46 -8 37
12 Preußen Münster, Deutschland Preußen Münster 30 9 9 12 35:39 -4 36
13 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 30 9 9 12 37:42 -5 36
14 FSV Zwickau, Deutschland FSV Zwickau 30 9 9 12 30:39 -9 36
15 VfL Osnabrück, Deutschland VfL Osnabrück 30 8 10 12 41:49 -8 34
16 FC Carl Zeiss Jena, Deutschland FC Carl Zeiss Jena 30 8 9 13 33:44 -11 33
17 Sportfreunde Lotte, Deutschland Sportfreunde Lotte 30 8 6 16 33:47 -14 30
18 Werder Bremen II, Deutschland Werder Bremen II 30 3 11 16 26:49 -23 20
19 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 30 7 5 18 36:60 -24 17
20 Rot-Weiß Erfurt, Deutschland Rot-Weiß Erfurt 30 4 8 18 23:53 -30 10
  Aufstieg
  Relegation
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen.

# Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt.