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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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SC Paderborn 07 | 30 | 15 | 10 | 5 | 28:12 | 16 | 55 |
| 2 |
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SV Wehen Wiesbaden | 30 | 13 | 12 | 5 | 30:12 | 18 | 51 |
| 3 |
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1. FC Magdeburg | 30 | 12 | 12 | 6 | 34:16 | 18 | 48 |
| 4 |
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Hansa Rostock | 30 | 12 | 12 | 6 | 18:10 | 8 | 48 |
| 5 |
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Karlsruher SC | 30 | 11 | 14 | 5 | 16:11 | 5 | 47 |
| 6 |
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Fortuna Köln | 30 | 10 | 14 | 6 | 24:17 | 7 | 44 |
| 7 |
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VfR Aalen | 30 | 9 | 14 | 7 | 19:16 | 3 | 41 |
| 8 |
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SV Meppen | 30 | 10 | 11 | 9 | 16:14 | 2 | 41 |
| 9 |
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FSV Zwickau | 30 | 9 | 11 | 10 | 17:18 | -1 | 38 |
| 10 |
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FC Carl Zeiss Jena | 30 | 7 | 17 | 6 | 16:18 | -2 | 38 |
| 11 |
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SpVgg Unterhaching | 30 | 9 | 10 | 11 | 20:18 | 2 | 37 |
| 12 |
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Chemnitzer FC | 30 | 8 | 13 | 9 | 17:23 | -6 | 37 |
| 13 |
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Würzburger Kickers | 30 | 9 | 9 | 12 | 12:18 | -6 | 36 |
| 14 |
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VfL Osnabrück | 30 | 9 | 8 | 13 | 19:26 | -7 | 35 |
| 15 |
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Hallescher FC | 30 | 7 | 13 | 10 | 16:19 | -3 | 34 |
| 16 |
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Preußen Münster | 30 | 8 | 10 | 12 | 15:22 | -7 | 34 |
| 17 |
|
SG Sonnenhof Großaspach | 30 | 7 | 12 | 11 | 15:26 | -11 | 33 |
| 18 |
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Werder Bremen II | 30 | 5 | 16 | 9 | 12:22 | -10 | 31 |
| 19 |
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Sportfreunde Lotte | 30 | 5 | 13 | 12 | 16:25 | -9 | 28 |
| 20 |
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Rot-Weiß Erfurt | 30 | 2 | 15 | 13 | 9:26 | -17 | 21 |
| Aufstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen. # Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. |
