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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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SV Wehen Wiesbaden | 31 | 17 | 8 | 6 | 38:17 | 21 | 59 |
| 2 |
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SC Paderborn 07 | 31 | 15 | 9 | 7 | 36:18 | 18 | 54 |
| 3 |
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Karlsruher SC | 31 | 14 | 10 | 7 | 22:11 | 11 | 52 |
| 4 |
|
Würzburger Kickers | 31 | 13 | 11 | 7 | 28:24 | 4 | 50 |
| 5 |
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1. FC Magdeburg | 31 | 12 | 12 | 7 | 23:14 | 9 | 48 |
| 6 |
|
Fortuna Köln | 31 | 13 | 8 | 10 | 25:17 | 8 | 47 |
| 7 |
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SG Sonnenhof Großaspach | 31 | 12 | 9 | 10 | 23:22 | 1 | 45 |
| 8 |
|
SpVgg Unterhaching | 31 | 12 | 8 | 11 | 26:26 | 0 | 44 |
| 9 |
|
Hallescher FC | 31 | 13 | 5 | 13 | 23:23 | 0 | 44 |
| 10 |
|
Hansa Rostock | 31 | 11 | 10 | 10 | 21:19 | 2 | 43 |
| 11 |
|
Preußen Münster | 31 | 10 | 10 | 11 | 21:17 | 4 | 40 |
| 12 |
|
FSV Zwickau | 31 | 9 | 11 | 11 | 15:21 | -6 | 38 |
| 13 |
|
VfR Aalen | 31 | 9 | 10 | 12 | 22:27 | -5 | 37 |
| 14 |
|
VfL Osnabrück | 31 | 8 | 12 | 11 | 22:25 | -3 | 36 |
| 15 |
|
SV Meppen | 31 | 9 | 9 | 13 | 19:24 | -5 | 36 |
| 16 |
|
Sportfreunde Lotte | 31 | 8 | 12 | 11 | 18:23 | -5 | 36 |
| 17 |
|
FC Carl Zeiss Jena | 31 | 8 | 10 | 13 | 17:26 | -9 | 34 |
| 18 |
|
Chemnitzer FC | 31 | 7 | 11 | 13 | 20:38 | -18 | 32 |
| 19 |
|
Werder Bremen II | 31 | 5 | 13 | 13 | 14:29 | -15 | 28 |
| 20 |
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Rot-Weiß Erfurt | 31 | 5 | 12 | 14 | 16:28 | -12 | 27 |
| Aufstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen. # Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. |
