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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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SC Paderborn 07 | 38 | 20 | 11 | 7 | 52:20 | 32 | 71 |
| 2 |
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Würzburger Kickers | 38 | 18 | 13 | 7 | 36:26 | 10 | 67 |
| 3 |
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1. FC Magdeburg | 38 | 17 | 14 | 7 | 30:15 | 15 | 65 |
| 4 |
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SV Wehen Wiesbaden | 38 | 18 | 10 | 10 | 43:24 | 19 | 64 |
| 5 |
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Karlsruher SC | 38 | 16 | 14 | 8 | 28:16 | 12 | 62 |
| 6 |
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SG Sonnenhof Großaspach | 38 | 15 | 12 | 11 | 31:27 | 4 | 57 |
| 7 |
|
Hallescher FC | 38 | 15 | 8 | 15 | 29:29 | 0 | 53 |
| 8 |
|
Hansa Rostock | 38 | 13 | 13 | 12 | 25:23 | 2 | 52 |
| 9 |
|
Fortuna Köln | 38 | 13 | 12 | 13 | 28:24 | 4 | 51 |
| 10 |
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SpVgg Unterhaching | 38 | 14 | 9 | 15 | 29:31 | -2 | 51 |
| 11 |
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Preußen Münster | 38 | 11 | 14 | 13 | 26:24 | 2 | 47 |
| 12 |
|
SV Meppen | 38 | 11 | 13 | 14 | 27:30 | -3 | 46 |
| 13 |
|
Sportfreunde Lotte | 38 | 11 | 13 | 14 | 24:29 | -5 | 46 |
| 14 |
|
FC Carl Zeiss Jena | 38 | 11 | 13 | 14 | 28:34 | -6 | 46 |
| 15 |
|
VfR Aalen | 38 | 11 | 13 | 14 | 27:34 | -7 | 46 |
| 16 |
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FSV Zwickau | 38 | 9 | 16 | 13 | 18:28 | -10 | 43 |
| 17 |
|
Chemnitzer FC | 38 | 9 | 15 | 14 | 26:42 | -16 | 42 |
| 18 |
|
VfL Osnabrück | 38 | 9 | 13 | 16 | 26:36 | -10 | 40 |
| 19 |
|
Werder Bremen II | 38 | 7 | 15 | 16 | 20:38 | -18 | 36 |
| 20 |
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Rot-Weiß Erfurt | 38 | 5 | 13 | 20 | 16:39 | -23 | 28 |
| Aufstieg | |
| Relegation | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen. # Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. |
