# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 1. FC Magdeburg, Deutschland 1. FC Magdeburg 19 15 3 1 41:11 30 48
2 SC Paderborn 07, Deutschland SC Paderborn 07 19 14 3 2 49:11 38 45
3 Karlsruher SC, Deutschland Karlsruher SC 19 13 5 1 29:9 20 44
4 SV Wehen Wiesbaden, Deutschland SV Wehen Wiesbaden 19 12 3 4 44:19 25 39
5 FC Carl Zeiss Jena, Deutschland FC Carl Zeiss Jena 19 10 6 3 29:24 5 36
6 VfR Aalen, Deutschland VfR Aalen 19 10 5 4 30:23 7 35
7 SV Meppen, Deutschland SV Meppen 19 9 7 3 31:20 11 34
8 Hansa Rostock, Deutschland Hansa Rostock 19 9 6 4 30:22 8 33
9 SpVgg Unterhaching, Deutschland SpVgg Unterhaching 19 10 3 6 33:27 6 33
10 Preußen Münster, Deutschland Preußen Münster 19 9 5 5 30:17 13 32
11 Fortuna Köln, Deutschland Fortuna Köln 19 9 4 6 27:22 5 31
12 Hallescher FC, Deutschland Hallescher FC 19 10 1 8 27:25 2 31
13 FSV Zwickau, Deutschland FSV Zwickau 19 8 5 6 24:24 0 29
14 Würzburger Kickers, Deutschland Würzburger Kickers 19 7 7 5 21:23 -2 28
15 Sportfreunde Lotte, Deutschland Sportfreunde Lotte 19 8 3 8 25:24 1 27
16 VfL Osnabrück, Deutschland VfL Osnabrück 19 6 7 6 30:28 2 25
17 SG Sonnenhof Großaspach, Deutschland SG Sonnenhof Großaspach 19 5 7 7 23:26 -3 22
18 Chemnitzer FC, Deutschland Chemnitzer FC 19 6 4 9 22:30 -8 22
19 Werder Bremen II, Deutschland Werder Bremen II 19 4 7 8 20:29 -9 19
20 Rot-Weiß Erfurt, Deutschland Rot-Weiß Erfurt 19 3 4 12 17:42 -25 13
  Aufstieg
  Relegation
  Abstieg

# Rot-Weiß Erfurt wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt. Ein weiterer Punkt wurde RWE wegen eines Verstoßes gegen Zulassungsauflagen abgezogen.

# Der Chemnitzer FC wurde nach Eröffnung des Insolvenzverfahrens mit einem Abzug von neun Punkten belegt.