15.05.2009 18:30 SV Seligenporten - SpVgg Ansbach 4:1
18:30 SpVgg Bayern Hof - SpVgg Weiden 1:4
18:30 FSV Erlangen-Bruck - TSV Aindling 2:1
18:30 Würzburger FV - SpVgg Bayreuth 2:0
16.05.2009 15:00 TSG Thannhausen - Würzburger Kickers 6:2
15:00 1. FC Schweinfurt 05 - TSV Buchbach 1:3
15:00 FC Ismaning - VfL Frohnlach 1:1
15:00 TSV 1896 Rain - FC Memmingen 2:2
15:00 1. FC Bad Kötzting - FC Ingolstadt 04 II 0:4
» Tabelle Heim Auswärts Hinrunde Rückrunde
# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 SpVgg Weiden, Deutschland SpVgg Weiden 32 22 7 3 63:25 38 73
2 TSV Aindling, Deutschland TSV Aindling 32 17 10 5 66:27 39 61
3 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 32 16 8 8 45:31 14 56
4 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 32 15 9 8 46:34 12 54
5 FSV Erlangen-Bruck, Deutschland FSV Erlangen-Bruck 32 13 12 7 58:42 16 51
6 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 32 13 10 9 48:40 8 49
7 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 32 11 10 11 44:41 3 43
8 VfL Frohnlach, Deutschland VfL Frohnlach 32 11 8 13 61:55 6 41
9 SpVgg Bayern Hof, Deutschland SpVgg Bayern Hof 32 11 8 13 40:42 -2 41
10 FC Ismaning, Deutschland FC Ismaning 32 12 4 16 58:55 3 40
11 TSG Thannhausen, Deutschland TSG Thannhausen 32 11 6 15 51:55 -4 39
12 SpVgg Ansbach, Deutschland SpVgg Ansbach 32 9 11 12 35:47 -12 38
13 1. FC Bad Kötzting, Deutschland 1. FC Bad Kötzting 32 10 8 14 41:61 -20 38
14 Würzburger FV, Deutschland Würzburger FV 32 8 12 12 44:51 -7 36
15 SV Seligenporten, Deutschland SV Seligenporten 32 7 14 11 36:50 -14 35
16 TSV 1896 Rain, Deutschland TSV 1896 Rain 32 9 7 16 45:66 -21 34
17 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 32 9 6 17 37:65 -28 33
18 Würzburger Kickers, Deutschland Würzburger Kickers 32 8 2 22 49:80 -31 26

# Erstmals seit der Saison 1977/78 beendeten drei Teams in der Abstiegszone die Saison punktgleich. Daher mussten zwischen dem TSV Rain am Lech, dem Würzburger FV und dem FV Seligenporten drei Entscheidungsspiele um Klassenerhalt, Relegation bzw. Abstieg ausgetragen werden. Aufsteiger Rain siegte 2:0 gegen Würzburg und 5:1 gegen Seligenporten und hielt so die Klasse. Im dritten Spiel gewann Seligenporten 4:0 gegen Würzburg, womit nach den Kickers auch der zweite Würzburger Verein absteigen musste. Seligenporten sicherte schließlich in den Relegationsspielen die Zugehörigkeit zur Bayernliga.
Bayernliga (1994-2012)
Bayernliga (1994-2012)