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| 05.05.2017 | 18:00 | FC Flora | - | Tulevik Viljandi | 7:0 (3:0) | |
| 18:00 | Pärnu JK Vaprus | - | FC Levadia | 1:2 (0:2) | ||
| 18:30 | JK Sillamäe Kalev | - | JK Narva Trans | 1:1 (0:1) | ||
| 06.05.2017 | 12:00 | Paide Linnameeskond | - | FC Infonet | 1:1 (0:0) | |
| 18:00 | JK Nõmme Kalju | - | JK Tammeka | 5:1 (2:0) |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FC Levadia | 10 | 8 | 2 | 0 | 32:4 | 28 | 26 |
| 2 |
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FC Flora | 10 | 8 | 2 | 0 | 27:4 | 23 | 26 |
| 3 |
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JK Nõmme Kalju | 10 | 7 | 2 | 1 | 30:10 | 20 | 23 |
| 4 |
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JK Narva Trans | 10 | 5 | 2 | 3 | 19:14 | 5 | 17 |
| 5 |
|
FC Infonet | 10 | 4 | 2 | 4 | 24:12 | 12 | 14 |
| 6 |
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Paide Linnameeskond | 10 | 3 | 2 | 5 | 12:29 | -17 | 11 |
| 7 |
|
JK Tammeka | 10 | 2 | 4 | 4 | 11:19 | -8 | 10 |
| 8 |
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JK Sillamäe Kalev | 10 | 1 | 3 | 6 | 10:20 | -10 | 6 |
| 9 |
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Tulevik Viljandi | 10 | 2 | 0 | 8 | 7:33 | -26 | 6 |
| 10 |
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Pärnu JK Vaprus | 10 | 0 | 1 | 9 | 8:35 | -27 | 1 |
| Champions League Quali. | |
| Abstieg |
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# Pärnu Linnameskond wurde am 11. Januar 2017 aufgelöst. Die Erstligalizenz ging an Pärnu JK Vaprus. # JK Sillamäe Kalev steht am Ende der Saison 2017 als einziger Absteiger durch Lizenzentzug fest. |
