# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Levadia, Estland FC Levadia 11 9 2 0 34:5 29 29
2 FC Flora, Estland FC Flora 11 9 2 0 29:4 25 29
3 JK Nõmme Kalju, Estland JK Nõmme Kalju 11 7 2 2 31:12 19 23
4 FC Infonet, Estland FC Infonet 11 5 2 4 27:12 15 17
5 JK Narva Trans, Estland JK Narva Trans 11 5 2 4 19:16 3 17
6 Paide Linnameeskond, Estland Paide Linnameeskond 11 3 3 5 12:29 -17 12
7 JK Tammeka, Estland JK Tammeka 11 2 5 4 11:19 -8 11
8 JK Sillamäe Kalev, Estland JK Sillamäe Kalev 11 1 3 7 10:23 -13 6
9 Tulevik Viljandi, Estland Tulevik Viljandi 11 2 0 9 7:35 -28 6
10 Pärnu JK Vaprus, Estland Pärnu JK Vaprus 11 1 1 9 10:35 -25 4
  Champions League Quali.
  Abstieg

# Pärnu Linnameskond wurde am 11. Januar 2017 aufgelöst. Die Erstligalizenz ging an Pärnu JK Vaprus.

# JK Sillamäe Kalev steht am Ende der Saison 2017 als einziger Absteiger durch Lizenzentzug fest.