# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Flora, Estland FC Flora 31 25 4 2 86:26 60 79
2 FC Levadia, Estland FC Levadia 31 22 7 2 93:18 75 73
3 JK Nõmme Kalju, Estland JK Nõmme Kalju 31 21 5 5 83:24 59 68
4 FC Infonet, Estland FC Infonet 31 18 4 9 92:39 53 58
5 JK Narva Trans, Estland JK Narva Trans 31 12 5 14 44:47 -3 41
6 JK Tammeka, Estland JK Tammeka 31 7 9 15 35:55 -20 30
7 JK Sillamäe Kalev, Estland JK Sillamäe Kalev 31 8 6 17 42:68 -26 30
8 Paide Linnameeskond, Estland Paide Linnameeskond 31 7 7 17 38:79 -41 28
9 Tulevik Viljandi, Estland Tulevik Viljandi 31 7 3 21 30:83 -53 24
10 Pärnu JK Vaprus, Estland Pärnu JK Vaprus 31 2 2 27 23:127 -104 8
  Champions League Quali.
  Abstieg

# Pärnu Linnameskond wurde am 11. Januar 2017 aufgelöst. Die Erstligalizenz ging an Pärnu JK Vaprus.

# JK Sillamäe Kalev steht am Ende der Saison 2017 als einziger Absteiger durch Lizenzentzug fest.