# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 FC Levadia, Estland FC Levadia 4 3 1 0 14:1 13 10
2 JK Nõmme Kalju, Estland JK Nõmme Kalju 4 3 1 0 10:4 6 10
3 FC Flora, Estland FC Flora 4 2 2 0 8:2 6 8
4 JK Narva Trans, Estland JK Narva Trans 4 2 1 1 9:5 4 7
5 FC Infonet, Estland FC Infonet 4 2 0 2 7:4 3 6
6 JK Tammeka, Estland JK Tammeka 4 1 2 1 4:6 -2 5
7 JK Sillamäe Kalev, Estland JK Sillamäe Kalev 4 1 0 3 4:9 -5 3
8 Tulevik Viljandi, Estland Tulevik Viljandi 4 1 0 3 4:10 -6 3
9 Paide Linnameeskond, Estland Paide Linnameeskond 4 1 0 3 4:15 -11 3
10 Pärnu JK Vaprus, Estland Pärnu JK Vaprus 4 0 1 3 4:12 -8 1
  Champions League Quali.
  Abstieg

# Pärnu Linnameskond wurde am 11. Januar 2017 aufgelöst. Die Erstligalizenz ging an Pärnu JK Vaprus.

# JK Sillamäe Kalev steht am Ende der Saison 2017 als einziger Absteiger durch Lizenzentzug fest.