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| 24.04.2017 | 18:00 | FC Infonet | - | JK Sillamäe Kalev | 2:2 (2:1) | |
| 25.04.2017 | 17:00 | FC Levadia | - | JK Nõmme Kalju | 1:1 (1:0) | |
| 18:00 | Paide Linnameeskond | - | JK Tammeka | 1:1 (0:1) | ||
| 18:00 | Tulevik Viljandi | - | Pärnu JK Vaprus | 2:1 (1:0) | ||
| 19:00 | FC Flora | - | JK Narva Trans | 4:2 (2:0) |
| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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FC Levadia | 8 | 6 | 2 | 0 | 22:3 | 19 | 20 |
| 2 |
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FC Flora | 8 | 6 | 2 | 0 | 18:4 | 14 | 20 |
| 3 |
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JK Nõmme Kalju | 8 | 5 | 2 | 1 | 22:8 | 14 | 17 |
| 4 |
|
JK Narva Trans | 8 | 4 | 1 | 3 | 15:12 | 3 | 13 |
| 5 |
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FC Infonet | 8 | 3 | 1 | 4 | 17:10 | 7 | 10 |
| 6 |
|
JK Tammeka | 8 | 2 | 4 | 2 | 9:11 | -2 | 10 |
| 7 |
|
Paide Linnameeskond | 8 | 3 | 1 | 4 | 10:22 | -12 | 10 |
| 8 |
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Tulevik Viljandi | 8 | 2 | 0 | 6 | 7:24 | -17 | 6 |
| 9 |
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JK Sillamäe Kalev | 8 | 1 | 2 | 5 | 8:16 | -8 | 5 |
| 10 |
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Pärnu JK Vaprus | 8 | 0 | 1 | 7 | 7:25 | -18 | 1 |
| Champions League Quali. | |
| Abstieg |
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# Pärnu Linnameskond wurde am 11. Januar 2017 aufgelöst. Die Erstligalizenz ging an Pärnu JK Vaprus. # JK Sillamäe Kalev steht am Ende der Saison 2017 als einziger Absteiger durch Lizenzentzug fest. |
