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| # | Mannschaft | Sp. | S. | U. | N. | Tore | Dif. | Pk. | |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 |
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1. FC Lok Leipzig | 15 | 10 | 5 | 0 | 35:6 | 29 | 35 |
| 2 |
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Inter Leipzig | 15 | 10 | 3 | 2 | 34:12 | 22 | 33 |
| 3 |
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Bischofswerdaer FV | 15 | 8 | 5 | 2 | 33:14 | 19 | 29 |
| 4 |
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FC Carl Zeiss Jena II | 15 | 7 | 5 | 3 | 34:16 | 18 | 26 |
| 5 |
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FSV Barleben | 15 | 6 | 4 | 5 | 32:23 | 9 | 22 |
| 6 |
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VfL Halle 96 | 15 | 6 | 4 | 5 | 34:29 | 5 | 22 |
| 7 |
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Askania Bernburg | 15 | 6 | 4 | 5 | 25:22 | 3 | 22 |
| 8 |
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Rot-Weiß Erfurt II | 15 | 6 | 2 | 7 | 34:40 | -6 | 20 |
| 9 |
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FC Einheit Rudolstadt | 15 | 5 | 4 | 6 | 22:19 | 3 | 19 |
| 10 |
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VFC Plauen | 15 | 5 | 4 | 6 | 25:29 | -4 | 19 |
| 11 |
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Union Sandersdorf | 15 | 5 | 4 | 6 | 18:24 | -6 | 19 |
| 12 |
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SV SCHOTT Jena | 15 | 5 | 3 | 7 | 20:34 | -14 | 18 |
| 13 |
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SSV Markranstädt | 15 | 4 | 5 | 6 | 24:25 | -1 | 17 |
| 14 |
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Energie Cottbus II | 15 | 4 | 3 | 8 | 20:35 | -15 | 15 |
| 15 |
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BSG Wismut Gera | 15 | 3 | 3 | 9 | 13:27 | -14 | 12 |
| 16 |
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FC Eisenach | 15 | 1 | 0 | 14 | 6:54 | -48 | 3 |
| Aufstieg | |
| Abstieg |
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# Rot-Weiß Erfurt II und Energie Cottbus II wurden zum Saisonende zurückgezogen. Dadurch verringerte sich die Zahl der sportlichen Absteiger. # Der FC Eisenach beantragte für die Saison 2016/2017 keine Oberligalizenz |
