# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bayern München II, Deutschland Bayern München II 2 2 0 0 6:1 5 6
2 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 2 2 0 0 6:2 4 6
3 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 2 2 0 0 5:1 4 6
4 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 2 2 0 0 4:2 2 6
5 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 2 1 1 0 5:2 3 4
6 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 2 1 1 0 3:2 1 4
7 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 2 1 0 1 7:4 3 3
8 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 2 1 0 1 4:4 0 3
9 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 2 1 0 1 2:2 0 3
10 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 2 1 0 1 4:5 -1 3
11 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 2 1 0 1 2:3 -1 3
12 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 2 1 0 1 3:5 -2 3
13 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 2 0 1 1 2:6 -4 1
14 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 2 0 0 2 3:5 -2 0
15 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 2 0 0 2 1:3 -2 0
16 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 2 0 0 2 0:4 -4 0
17 FC Pipinsried, Deutschland FC Pipinsried 2 0 0 2 2:7 -5 0
18 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 2 0 1 1 2:3 -1 -44
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz.