# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bayern München II, Deutschland Bayern München II 31 21 6 4 67:26 41 69
2 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 31 19 6 6 64:39 25 63
3 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 31 15 9 7 47:32 15 54
4 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 31 13 12 6 51:39 12 51
5 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 31 14 7 10 44:38 6 49
6 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 31 12 8 11 49:50 -1 44
7 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 31 12 7 12 47:40 7 43
8 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 31 11 9 11 46:41 5 42
9 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 31 12 5 14 49:56 -7 41
10 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 31 11 8 12 37:44 -7 41
11 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 31 9 10 12 42:48 -6 37
12 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 31 8 12 11 43:51 -8 36
13 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 31 9 7 15 42:45 -3 34
14 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 31 9 5 17 36:48 -12 32
15 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 31 9 5 17 45:60 -15 32
16 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 31 8 7 16 30:53 -23 31
17 FC Pipinsried, Deutschland FC Pipinsried 31 7 8 16 42:65 -23 29
18 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 31 10 9 12 41:47 -6 -6
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz.