# Mannschaft Sp. S. U. N. Tore Dif. Pk.
1 Bayern München II, Deutschland Bayern München II 33 22 7 4 71:28 43 73
2 VfB Eichstätt, Deutschland VfB Eichstätt 33 19 8 6 67:42 25 65
3 1. FC Nürnberg II, Deutschland 1. FC Nürnberg II 33 15 9 9 48:36 12 54
4 Wacker Burghausen, Deutschland Wacker Burghausen 33 15 8 10 48:40 8 53
5 1. FC Schweinfurt 05, Deutschland 1. FC Schweinfurt 05 33 13 13 7 52:42 10 52
6 FV Illertissen, Deutschland FV Illertissen 33 14 5 14 57:60 -3 47
7 TSV Buchbach, Deutschland TSV Buchbach 33 13 7 13 50:45 5 46
8 SpVgg Bayreuth, Deutschland SpVgg Bayreuth 33 12 9 12 51:46 5 45
9 FC Memmingen, Deutschland FC Memmingen 33 12 9 12 51:55 -4 45
10 SV Schalding-Heining, Deutschland SV Schalding-Heining 33 11 8 14 39:49 -10 41
11 Viktoria Aschaffenburg, Deutschland Viktoria Aschaffenburg 33 9 13 11 46:53 -7 40
12 FC Augsburg II, Deutschland FC Augsburg II 33 11 5 17 42:49 -7 38
13 VfR Garching, Deutschland VfR Garching 33 9 11 13 43:51 -8 38
14 SpVgg Greuther Fürth II, Deutschland SpVgg Greuther Fürth II 33 9 8 16 44:49 -5 35
15 TSV 1860 Rosenheim, Deutschland TSV 1860 Rosenheim 33 9 7 17 36:58 -22 34
16 FC Pipinsried, Deutschland FC Pipinsried 33 8 9 16 45:66 -21 33
17 SV Heimstetten, Deutschland SV Heimstetten 33 9 5 19 45:72 -27 32
18 FC Ingolstadt 04 II, Deutschland FC Ingolstadt 04 II 33 12 9 12 53:47 6 0
  Playoffs
  Relegation
  Abstieg

# Durch den Abstieg der Profimannschaft des FC Ingolstadt 04 in die 3. Liga wurde der FC Ingolstadt 04 II mit 0 Punkten an das Ende der Tabelle gesetzt. Die erspielten Ergebnisse behalten aber ihre Gültigkeit. Das Team lag am Ende der Saison eigentlich mit 45 Punkten auf dem neunten Tabellenplatz.